儿童急性髓系白血病诊断时样本的Affymetrix SNP芯片数据:Xba SNP芯片

该数据集来自omicsdi.org,为儿童急性髓系白血病(AML)诊断时样本的Affymetrix SNP芯片数据,采用Xba SNP芯片

omicsdi
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时间序列分类Transcriptomics
Affymetrix SNP array data for pediatric acute myeloid leukemia (AML) samples at diagnosis: Xba SNP array

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

儿童急性髓系白血病诊断时样本的Affymetrix SNP芯片数据:Xba SNP芯片

该数据集来自omicsdi.org,为儿童急性髓系白血病(AML)诊断时样本的Affymetrix SNP芯片数据,采用Xba SNP芯片。研究对111例儿童AML样本进行全基因组拷贝数变异(CNA)和杂合性缺失(LOH)分析,其中65例有配对的生殖系材料。数据可用于表征儿童AML各亚型的CNA和LOH特征,补充文件包含dChip生成的未归一化原始信号(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对儿童AML的拷贝数变异(CNA)和杂合性缺失(LOH)进行全基因组分析,并进行基因表达和重测序。本研究通过儿童AML各亚型的代表性横断面来表征CNA和LOH。按照制造商说明,对从冷冻保存的诊断骨髓或外周血样本中提取的DNA进行Affymetrix SNP芯片检测。使用Affymetrix 100K + 500K 5.0 SNP芯片对111例儿童AML样本进行了研究,其中65例样本有配对的生殖系材料。补充文件'GSE15732_AML_175_SNP_Xba_signal.txt'包含dChip生成的未经归一化的原始信号。CNA和LOH数据可在相关手稿的补充信息中找到。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-15732

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

儿童AML中拷贝数改变(CNA)和杂合性缺失(LOH)的全基因组分析、基因表达及重测序。本研究通过儿童AML各亚型的代表性横截面,描述了CNA和LOH的特征。根据制造商指南,对从冷冻保存的诊断性骨髓或外周血样本中提取的DNA进行了Affymetrix SNP芯片检测。使用Affymetrix 100K + 500K 5.0 SNP芯片对111例儿童AML样本进行了研究,其中65例样本有配对的生殖系材料。补充文件“GSE15732_AML_175_SNP_Xba_signal.txt”包含由dChip生成未经标准化的原始信号。CNA和LOH数据可见于相关稿件的补充信息中。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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