NUP98重排急性白血病的Affymetrix SNP芯片数据
该数据集为NUP98重排急性白血病的Affymetrix SNP芯片数据，来源于ebi.ac.uk，分类为肿瘤/白血病。源站描述显示，研究通过FICTION单细胞分析评估了NUP98易位在MDS、AML和T-ALL中的谱系累及情况，涉及NSD1、DDX10、RAP1GDS1和LNP1等伙伴基因，并发
基本信息
资源简介
NUP98重排急性白血病的Affymetrix SNP芯片数据
Affymetrix SNP array data for NUP98 rearranged acute leukemias
该数据集为NUP98重排急性白血病的Affymetrix SNP芯片数据，来源于ebi.ac.uk，分类为肿瘤/白血病。源站描述显示，研究通过FICTION单细胞分析评估了NUP98易位在MDS、AML和T-ALL中的谱系累及情况，涉及NSD1、DDX10、RAP1GDS1和LNP1等伙伴基因，并发现不同白血病亚型中异常克隆的累及细胞类型存在差异，同时识别了FLT3、CEBPA、NOTCH1突变及MYB重复等额外打击。该数据可用于白血病分子机制与克隆演化研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们评估了骨髓增生异常综合征（MDS）、急性髓系白血病（AML）和T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）中NUP98易位的谱系累及情况。通过FICTION（荧光免疫表型和间期细胞遗传学作为肿瘤研究工具）进行的单细胞分析显示，与不同伙伴基因（即NSD1、DDX10、RAP1GDS1和LNP1）形成的NUP98易位总是影响CD34+/CD133+造血前体细胞。有趣的是，在MDS/AML中，髓单核细胞、红系细胞、B和T淋巴细胞属于异常克隆，而在T-ALL中仅CD7+/CD3+细胞受累。伙伴基因似乎对决定白血病表型不起主要作用，如具有相同NUP98-RAP1GDS1融合的AML和T-ALL所示。还识别了额外打击，即MDS/AML中的FLT3和CEBPA突变以及T-ALL中的NOTCH1突变加MYB重复。
【主题与分类】
主题标签：Homo sapiens。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-60733
下载信息
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源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-60733
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-60733 Affymetrix SNP 阵列数据，用于 NUP98 重排急性白血病的比较基因组杂交，采用阵列 EFO EFO_0000749 人类。我们评估了 NUP98 易位在骨髓增生异常综合征（MDS）、急性髓系白血病（AML）和 T 细胞急性中的谱系累及情况。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
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