急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤对比

该数据集来自 ebi.ac.uk,主题为急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤的对比。数据取自 6 例急性淋巴细胞白血病患者的外周血或骨髓中的白血病细胞,用于生成小鼠异种移植瘤,并对两种样本来源进行比较

biostudies
浏览 8
基因组分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Acute Lymphocytic Leukemia versus associated xenografts

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤对比

该数据集名为 Acute Lymphocytic Leukemia versus associated xenografts,收录于 ebi.ac.uk,本站分类为肿瘤 / 白血病。其核心内容围绕急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤之间的对比展开。研究从 6 例急性淋巴细胞白血病患者体内获取白血病细胞,样本来源为外周血或骨髓,并将这些细胞用于生成小鼠异种移植瘤,进而对两种样本来源进行比较。数据集共包含六对人源白血病样本与相应异种移植瘤样本的配对比较,主题标签涉及 transcription profiling by array 与 Homo sapiens,说明其数据属于人类转录组层面的芯片表达谱研究。整体而言,该数据集为理解急性淋巴细胞白血病细胞在体内异种移植环境下的转录特征变化提供了样本配对比较基础。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是一种涉及淋巴细胞系异常的血液系统恶性肿瘤,其研究常需要借助模型系统来观察白血病细胞在体内的行为。该数据集所关注的问题,是比较患者来源的白血病细胞与由其生成的小鼠异种移植瘤之间的差异。源站描述指出,白血病细胞可从外周血或骨髓获得,而这两种来源可能影响后续异种移植的结果。因此,研究者从 6 例患者中分别获取细胞,建立小鼠异种移植瘤,并设计成六对人源白血病与相关异种移植瘤的配对比较。这一背景决定了数据集的核心价值在于配对样本之间的转录谱对比,而非单纯的疾病分类或健康对照研究。

【数据内容】

数据集的主题标签为 transcription profiling by array 和 Homo sapiens,表明其数据形式为基于芯片的转录谱检测,研究对象为人源样本。源站描述明确提到,共比较了六对人白血病样本与相关异种移植瘤样本。每一对均包含来自同一患者体系的白血病细胞及其对应的小鼠异种移植瘤,从而支持在配对框架下分析基因表达层面的异同。关于具体的基因数量、探针平台、表达值范围、差异表达基因列表或统计显著性指标,源站未提供。数据集名称中的“versus”体现了比较性设计,即人源白血病细胞与相关异种移植瘤之间的对照关系。

【采集与来源】

样本采集自 6 例急性淋巴细胞白血病患者。白血病细胞的来源为外周血或骨髓,二者均被用于生成小鼠异种移植瘤。源站描述强调,研究对这两种样本来源进行了比较,说明外周血来源与骨髓来源的白血病细胞在异种移植过程中可能被分别考察。数据来源于 ebi.ac.uk,本站分类为肿瘤 / 白血病。关于患者的年龄、性别、疾病亚型、治疗史、样本采集时间、伦理审批信息以及小鼠品系、移植方法等具体细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于急性淋巴细胞白血病与异种移植瘤之间的转录组比较研究。由于包含六对人源白血病与相关异种移植瘤的配对样本,可用于探索白血病细胞在移植到小鼠体内后表达谱发生的变化,也可用于评估外周血来源与骨髓来源样本在异种移植中的差异。主题标签中的 transcription profiling by array 提示其适合芯片表达谱相关的分析,例如样本聚类、配对差异分析或跨样本表达模式比较。对于关注白血病异种移植模型的研究者,该数据集可作为方法学参考或二次分析的起点。但具体分析目标、可用工具和预期结论需结合源站提供的原始数据与平台信息确定,源站未提供相关分析指南。

【使用方法】

该数据集可通过 ebi.ac.uk 获取,具体下载方式、文件格式、数据组织结构和配套元数据需以源站说明为准。由于主题标签为 transcription profiling by array,使用者通常需要具备芯片表达谱数据处理的基础知识,包括数据标准化、探针注释和配对样本比较等通用流程。关于是否提供原始数据、处理后的表达矩阵、平台注释文件或分析代码,源站未提供。使用时应遵循源站的数据访问与使用条款,并注意样本配对关系,以确保人源白血病与异种移植瘤之间的比较在分析中得以正确体现。

【质量与限制】

该数据集基于 6 例患者,样本量较小,可能限制统计推断的普遍性。源站描述仅说明比较了六对人白血病与相关异种移植瘤,未提供技术重复、生物学重复、批次信息或数据质控指标。关于样本纯度、细胞活力、移植成功率、芯片检测质量以及是否存在缺失数据,源站未提供。由于涉及人源样本与小鼠异种移植瘤的跨物种比较,分析时需注意物种来源差异对转录谱解读的影响。此外,外周血与骨髓两种来源的混合使用可能引入样本来源异质性,但源站未提供按来源分层的详细结果。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体引用方式、许可协议、数据使用限制以及是否允许再分发或商业使用,源站未提供。使用者应直接访问源站页面,查阅其标注的引用要求与许可条款。在发表基于该数据集的分析结果时,建议按照源站要求进行引用,并遵守相应的数据共享与隐私保护规定。

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源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-15621

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-15621 急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤的转录谱分析(微阵列) EFO EFO_0002768 智人 从6名急性淋巴细胞白血病患者的外周血或骨髓中获取白血病细胞。这些细胞被用于生成小鼠

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