10例慢性淋巴细胞白血病患者连续DNA甲基化谱(2个时间点)数据集
该数据集收录了10例慢性淋巴细胞白血病患者的连续DNA甲基化谱,每位患者包含2个时间点的检测结果,来源于omicsdi.org,主题标签为Genomics,本站归类为肿瘤/白血病

基本信息
资源简介
10例慢性淋巴细胞白血病患者连续DNA甲基化谱(2个时间点)数据集
该数据集收录了10例慢性淋巴细胞白血病患者的连续DNA甲基化谱,每位患者包含2个时间点的检测结果。数据集英文名称为“A dataset of sequential DNA methylation profiles (2 timepoints) of 10 patients with chronic lymphocytic leukemia)”,来源于omicsdi.org,主题标签为Genomics,本站将其归类为肿瘤/白血病。整体来看,该数据集聚焦于慢性淋巴细胞白血病这一血液系统恶性肿瘤,通过连续两个时间点的DNA甲基化检测,为观察患者甲基化谱的动态变化提供了样本材料。其核心价值在于“连续”与“多位点”两个特征:一方面,每位患者具有两个时间点的数据,可用于比较同一患者在不同时间节点上的甲基化状态;另一方面,10例患者的规模为群体层面的比较分析提供了基础。该数据集适合用于白血病相关甲基化研究、纵向样本分析以及基因组学层面的探索性工作。
【数据集背景】
慢性淋巴细胞白血病是一种以成熟B淋巴细胞克隆性增殖为特征的血液肿瘤,属于白血病的一种亚型。DNA甲基化作为表观遗传修饰的重要形式,在基因表达调控、细胞分化以及肿瘤发生发展过程中具有关键作用。对慢性淋巴细胞白血病患者进行DNA甲基化谱分析,有助于从表观遗传层面理解疾病状态及其变化。该数据集以“连续DNA甲基化谱”为核心内容,即对同一批患者在不同时间点分别进行甲基化检测,从而形成纵向数据。此类数据在肿瘤研究中具有特殊意义,因为它不仅反映某一时刻的甲基化状态,还能够体现随时间推移可能发生的甲基化改变。该数据集来源于omicsdi.org,主题标签为Genomics,本站将其归入肿瘤/白血病分类,说明其应用领域主要面向肿瘤学与基因组学交叉方向。
【数据内容】
该数据集包含10例慢性淋巴细胞白血病患者的连续DNA甲基化谱,每位患者具有2个时间点的检测结果。由此可知,数据集中的样本并非单一时点的横断面数据,而是同一患者在两个不同时间点上的配对样本。这种设计使得数据在结构上具有纵向特征,可用于比较同一患者两个时间点之间的甲基化差异。数据内容围绕DNA甲基化谱展开,属于基因组学范畴。关于具体的甲基化检测平台、覆盖的基因组区域、探针数量、甲基化位点数目、数据文件格式、样本分组信息、临床特征、时间间隔长度等细节,源站未提供。因此,在数据内容层面,可以确认的是患者数量、每位患者的时间点数量以及数据类型,其余具体技术参数与注释信息均无法从现有信息中获知。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。源站描述为“A dataset of sequential DNA methylation profiles (2 timepoints) of 10 patients with chronic lymphocytic leukemia”。主题标签为Genomics。本站分类为肿瘤/白血病。关于样本采集的具体机构、采集时间、采集地点、伦理审批信息、患者知情同意情况、样本处理流程、测序或芯片平台、数据生成时间等,源站未提供。因此,在采集与来源方面,仅能确认数据通过omicsdi.org发布,并围绕慢性淋巴细胞白血病患者的连续DNA甲基化谱展开。
【适用场景】
该数据集适用于慢性淋巴细胞白血病相关的表观遗传学研究,尤其是需要纵向比较的DNA甲基化分析。具体而言,可用于探索同一患者在两个时间点之间甲基化谱的差异,识别可能随时间变化的甲基化区域或位点;也可用于群体层面的描述性分析,例如在10例患者中观察甲基化模式的共性或异质性。此外,该数据集可作为基因组学研究的辅助数据,用于方法学验证、分析流程测试或与其他白血病甲基化数据集的比较研究。由于主题标签为Genomics,其适用方向主要集中于基因组学与表观遗传学交叉领域。关于是否适用于临床诊断、预后判断或治疗监测等具体应用,源站未提供相关信息,因此不应超出数据本身进行推断。
【使用方法】
该数据集的使用方法取决于源站提供的具体数据格式与访问方式,但源站未提供相关说明。一般而言,DNA甲基化谱数据可能需要经过预处理、质量控制、归一化等步骤后,才能用于差异甲基化分析或聚类分析。对于纵向数据,通常需要采用配对样本的分析策略,以考虑同一患者两个时间点之间的相关性。然而,关于该数据集的具体文件结构、下载方式、是否提供原始数据或处理后数据、是否附带分析代码或元数据表等,源站未提供。因此,使用者需依据omicsdi.org上的实际数据描述与文件内容自行判断分析路径。
【质量与限制】
该数据集包含10例患者、每位患者2个时间点,样本量相对有限,可能影响统计功效与结论的普遍性。由于源站未提供具体的检测平台、数据质量指标、缺失值情况、批次效应信息以及临床随访信息,无法对数据质量进行进一步评估。此外,该数据集仅涉及DNA甲基化谱,未提及基因表达、突变、拷贝数变异等其他组学数据,因此其分析维度相对单一。在解释结果时,应注意样本量小以及缺乏临床背景信息所带来的限制。关于数据是否存在伦理限制、使用范围限制或再分发限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等信息,源站未提供。使用者在利用该数据集时,应参考omicsdi.org上对应的数据条目,以获取准确的引用要求与许可说明。在未明确许可的情况下,不应假设该数据集可以自由用于商业目的或再分发。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA600397
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
A dataset of sequential DNA methylation profiles (2 timepoints) of 10 patients with chronic lymphocytic leukemia
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