慢性淋巴细胞白血病细胞中B细胞受体刺激诱导的核心增殖程序
该数据集来自omicsdi.org，聚焦肿瘤/白血病领域，研究慢性淋巴细胞白血病（CLL）细胞在B细胞受体（BCR）刺激后的增殖机制
基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病细胞中B细胞受体刺激诱导的核心增殖程序
该数据集来自omicsdi.org，聚焦肿瘤/白血病领域，研究慢性淋巴细胞白血病（CLL）细胞在B细胞受体（BCR）刺激后的增殖机制。通过对比侵袭性CLL患者中增殖与非增殖细胞，纵向刻画了BCR激活后转录组与蛋白质组的响应，鉴定出包含430个基因和374个蛋白的CLL增殖特征，并利用数学建模揭示了一个嵌套的亚调控网络。数据可用于研究BCR信号如何驱动肿瘤性B细胞增殖，支持增殖相关分子标志物发现、时间动态预测及生物网络逆向工程等分析（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：B细胞受体（BCR）信号对慢性淋巴细胞白血病（CLL）的病理生理学至关重要。尽管BCR最近已成为一个新的治疗靶点，但BCR信号控制肿瘤性B细胞增殖的确切机制仍未被充分表征。在此，通过比较侵袭性CLL患者的增殖细胞与非增殖细胞，我们纵向表征了CLL细胞在离体BCR接合后的转录组和蛋白质组响应。在BCR激活后表达受到调控的5,733个基因和/或蛋白质中，我们鉴定出一个CLL增殖特征，包含430个基因和374个蛋白质。对该特征进行数学建模揭示了一个嵌套的亚调控网络，该网络包含细胞激活后数小时内被激活的转录因子，这些转录因子与刺激后数天参与细胞增殖的蛋白质相关联。
【主题与分类】
主题标签：Mathematical modelling、Machine learning、Transcriptome and proteome、B-cell receptor (bcr)、Temporal response、Leukemogenesis、Chronic lymphocytic leukemia (cll)、Biological network reverse-engineering、Cellular program.、Lymphoproliferation。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD013573
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD013573
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
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- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
B细胞受体（BCR）信号在慢性淋巴细胞白血病（CLL）的病理生理学中至关重要。尽管BCR近来已成为新的治疗靶点，但BCR信号控制肿瘤性B细胞增殖的确切机制仍未被充分阐明。在此，通过比较侵袭性CLL患者中增殖与非增殖细胞，我们对离体BCR激活后CLL细胞的转录和蛋白质组反应进行了纵向表征。在BCR激活后表达受到调控的5，733个基因和/或蛋白质中，我们鉴定出一个包含430个基因和374个蛋白质的CLL增殖特征谱。对该特征谱的数学建模揭示了一个嵌套的亚调控网络，该网络由细胞激活后数小时内活化的转录因子与刺激后数天参与细胞增殖的蛋白质相关联。对这一维持原发性人类癌细胞增殖的核心细胞程序的挖掘，为创新性治疗前景提供了循证资源。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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