慢性髓性白血病干细胞全外显子测序数据（23例临床样本）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001009847

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们提供了23个慢性髓性白血病干细胞（CML-SC）临床样本以及两个口腔拭子来源的正常样本的全外显子DNA测序数据，格式为fastq。CML样本包括来自两名患者的4至8个重复样本，涵盖了诊断时和治疗后。治疗前的单个CML干细胞和缓解期的单个未转化造血干细胞（HSC）是根据新发现的遗传标记，在诊断时通过CD33+CD26+，在缓解期通过CD33+CD26-/CD33-CD26-，采用FACS从骨髓样本中筛选出来的。CML-SC和HSC群体的WES文库，源自集落形成实验，使用Agilent SureSelect Human All Exon V6试剂盒制备，并在Illumina NextSeq 500平台上以150个循环（2x 75bp配对末端）进行测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。