通过3'端RNA测序对平滑肌肉瘤分子亚型进行分层：迈向精准医学
基于3'端RNA测序的平滑肌肉瘤分子亚型分层数据集，用于精准医学研究。
基本信息
资源简介
通过3''端RNA测序对平滑肌肉瘤分子亚型进行分层：迈向精准医学
【一句话概览】
平滑肌肉瘤(LMS)（来源 BioStudies）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Stratification of Leiomyosarcoma molecular subtypes by 3'' end RNA-sequencing: Toward precision medicine》。
【数据内容】
源站原始描述：Leiomyosarcoma (LMS) is a malignant neoplasm with smooth muscle differentiation. Little is known about its molecular heterogeneity and no targeted therapy currently exists for LMS. We demonstrate the existence of 3 molecular subtypes in a cohort of 99 cases and an independent cohort of 82 LMS. Two new FFPE tissue-compatible diagnostic immunohistochemical markers are identified: LMOD1 for subtype I LMS and ARL4C for subtype II LMS. Subtype I and subtype II LMS are associated with good and poor pr…
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA、Homo sapiens。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-45510
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-45510
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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