透明细胞肾细胞癌基因表达荟萃分析：变异亚群与性别对肿瘤生物学的影响
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的基因表达荟萃分析。数据整合了 44 个新肿瘤样本与六个大型公开 ccRCC 基因表达数据库，累计覆盖 480 个肿瘤
基本信息
资源简介
透明细胞肾细胞癌基因表达荟萃分析：变异亚群与性别对肿瘤生物学的影响
该数据集围绕透明细胞肾细胞癌（clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）的基因表达展开荟萃分析，旨在通过整合多来源的转录组数据，刻画肿瘤的分子亚型特征及其与性别差异之间的关联。透明细胞肾细胞癌存在两个主要亚型，即 ccA 与 ccB，性别差异为疾病信息提供了额外线索；此外还存在一个较小的第三亚群，其表达谱具有独特性，与 von Hippel-Lindau 野生型状态一致，并表现出变异性组织学特征。该数据集共整合了 44 个新肿瘤样本以及六个大型公开可用的 ccRCC 基因表达数据库，累计为荟萃分析提供了 480 个肿瘤的数据，通过 meta-array 编译方式实现跨数据集整合。数据集主题标签为 Transcriptomics，本站分类归入肿瘤 / 肾癌，来源站为 omicsdi.org。
【数据集背景】
透明细胞肾细胞癌是肾癌中最常见的类型之一，其分子层面的异质性一直是研究重点。该数据集所依托的研究关注 ccRCC 的两个主要亚型 ccA 和 ccB，并进一步探讨性别差异在肿瘤生物学中的影响。研究还识别出一个第三 minor 亚群，该亚群具有独特的表达谱，与 von Hippel-Lindau 野生型状态相符，并呈现变异性组织学特征。这些发现提示，ccRCC 并非单一均质的疾病实体，而是在基因表达层面存在可区分的亚组结构，性别因素也可能参与塑造肿瘤的生物学行为。该数据集正是为支撑上述荟萃分析而构建，通过汇集多个独立来源的基因表达数据，提升对 ccRCC 分子分型及性别相关差异的统计把握度。
【数据内容】
数据集的核心内容是透明细胞肾细胞癌的基因表达数据，用于荟萃分析。其数据构成包括 44 个新肿瘤样本，以及来自六个大型公开 ccRCC 基因表达数据库的数据。这些数据累计覆盖 480 个肿瘤，通过 meta-array 编译方式进行整合。数据集的主题标签为 Transcriptomics，表明其聚焦于转录组层面的测量。源站描述提及 ccA 与 ccB 两个主要亚型，以及一个与 von Hippel-Lindau 野生型状态一致、具有变异性组织学特征的第三 minor 亚群，并指出性别差异可提供额外的疾病信息。除上述内容外，源站未提供关于具体基因列表、表达矩阵格式、样本临床注释字段等更细粒度的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。其数据由两部分构成：一是 44 个新肿瘤样本，二是六个大型、公开可用的 ccRCC 基因表达数据库。这些来源累计提供了 480 个肿瘤的数据，供荟萃分析使用。整合方式为 meta-array 编译。除上述来源信息外，源站未提供关于样本采集地点、时间跨度、平台型号、伦理审批或数据获取具体渠道的进一步说明。
【适用场景】
该数据集适用于透明细胞肾细胞癌基因表达相关的荟萃分析研究，尤其适合探讨 ccA 与 ccB 亚型的分子差异、性别对肿瘤生物学的影响，以及识别与 von Hippel-Lindau 野生型状态一致、具有变异性组织学特征的第三 minor 亚群。其转录组主题标签表明，该数据可用于基因表达层面的比较与整合分析。由于数据集整合了多个公开数据库与新增样本，也可用于跨数据集验证或作为二次分析的资源。除上述方向外，源站未提供关于其他具体适用场景的说明。
【使用方法】
源站未提供关于该数据集具体使用方法的说明，包括但不限于数据下载方式、文件格式、预处理流程、归一化方法、分析工具或代码等。因此，无法依据现有信息给出操作层面的使用指引。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量控制、批次效应处理、缺失值情况、样本纳入排除标准或统计效力评估等方面的具体说明。已知的信息仅包括数据规模（44 个新样本、六个公开数据库、累计 480 个肿瘤）以及整合方式（meta-array 编译）。关于数据是否存在平台异质性、人群代表性或亚型分类阈值等潜在限制，源站未提供进一步内容。
【引用与许可】
源站未提供关于该数据集的引用格式、文献出处、DOI、许可协议或使用条款等信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33093
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
透明细胞肾细胞癌包括两种主要亚型，ccA和ccB，性别差异提供了额外的疾病信息。第三个较小的亚群具有与von Hippel-Lindau野生型状态相符的独特表达谱，并显示出变异性组织学特征。通过meta-array汇编，识别出44个新的肿瘤样本和六个公开可用的大型ccRCC基因表达数据库，这些数据累计为480个肿瘤的荟萃分析提供了资料。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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