肾细胞癌细胞周期相关蛋白的组织病理学与低重免疫荧光数据集——韩国队列
该数据集包含一个独立的韩国透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者队列,收集于首尔大学医院。该队列由接受手术切除且无预先治疗的患者组成

基本信息
资源简介
肾细胞癌细胞周期相关蛋白的组织病理学与低重免疫荧光数据集——韩国队列
该数据集为一个独立的韩国透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者队列,收集于首尔大学医院,纳入的患者均接受了手术切除且无预先治疗。数据集同时提供组织病理学图像与低重数免疫荧光图像,用于细胞周期相关蛋白的研究。具体而言,它包含300张苏木精-伊红(H&E)全切片图像(WSI),提供详细的组织病理学背景信息,以及71张低重数免疫荧光(mIF)全切片图像。mIF检测面板靶向p21、MCM2和Lamin B1,并使用Hoechst作为细胞核复染。此外,还提供71张针对CD105的单重数免疫组织化学(IHC)图像,用于互补的血管分析。该数据集属于肿瘤/肾癌分类,来源站为ebi.ac.uk。
【数据集背景】
肾细胞癌是常见的泌尿系统肿瘤,其中透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是最主要的病理亚型。细胞周期相关蛋白在肿瘤发生、发展及增殖调控中具有重要作用,而组织病理学与免疫荧光成像的结合有助于在保留组织形态学背景的同时,对特定蛋白进行定位和定量分析。该数据集基于韩国人群建立了一个独立的ccRCC患者队列,所有患者均来自首尔大学医院,且均接受了手术切除、无预先治疗。这一设计有助于减少治疗相关因素对组织样本的干扰,为研究细胞周期相关蛋白在ccRCC中的表达模式提供图像资源。源站未提供该数据集的具体研究目的或立项背景的更多说明。
【数据内容】
数据集包含三类图像数据。第一类为300张H&E全切片图像(WSIs),用于提供详细的组织病理学背景。第二类为71张低重数免疫荧光(mIF)全切片图像,其检测面板靶向p21、MCM2和Lamin B1,并以Hoechst作为细胞核复染。第三类为71张单重数免疫组织化学(IHC)图像,针对CD105,采用DAB显色剂标记血管结构,用于互补的血管分析。源站描述中提到,每个肿瘤的主要衍生指标为百分比,但该句在提供的信息中未完整结束,因此无法给出该指标的完整定义或具体数值。除上述内容外,源站未提供关于图像数量之外的临床信息、蛋白表达评分、随访数据或其他衍生指标的详细说明。
【采集与来源】
该队列收集于首尔大学医院,患者为韩国人群,均接受手术切除且无预先治疗。所有H&E全切片图像均使用Zeiss Axio Scan.Z1扫描仪在20×放大倍数下采集。所有mIF切片的自动化图像分析均使用HALO®软件完成。数据集来源站为ebi.ac.uk。源站未提供mIF和IHC图像的扫描设备、放大倍数、染色流程、抗体克隆号或扫描参数等更多技术细节,也未提供患者招募时间范围、样本采集流程或伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集可用于肾细胞癌特别是透明细胞肾细胞癌的组织病理学与免疫荧光图像分析研究。H&E全切片图像适合用于组织形态学观察、肿瘤区域识别以及病理图像算法开发。mIF全切片图像针对p21、MCM2和Lamin B1,可用于研究细胞周期相关蛋白的空间表达模式,并结合Hoechst核复染进行细胞核定位。CD105单重数IHC图像可用于血管分析。由于该队列来自韩国人群且患者均未接受预先治疗,该数据集也可用于特定人群或未经治疗条件下的图像特征探索。源站未提供该数据集在具体研究任务中的验证结果或基准性能。
【使用方法】
使用该数据集时,可分别或联合利用H&E、mIF和IHC三类全切片图像。H&E图像可用于提供组织病理学背景,mIF图像可用于靶向p21、MCM2和Lamin B1的荧光信号分析,IHC图像可用于CD105标记的血管结构分析。源站描述指出,mIF切片的自动化图像分析使用HALO®软件完成,因此相关分析可参考该软件的处理流程。源站未提供数据下载方式、文件格式、图像分辨率、数据组织目录、配套代码或分析脚本等具体使用说明。
【质量与限制】
该数据集的一个明确限制是样本量与图像类型不完全对称:H&E全切片图像为300张,而mIF全切片图像和CD105单重数IHC图像均为71张。此外,该队列仅来自首尔大学医院,且为韩国人群,患者均接受手术切除且无预先治疗,因此其结论外推到其他人群、其他治疗背景或其他病理亚型时需谨慎。源站未提供图像质量评估、批次效应、扫描伪影、染色一致性或缺失数据等方面的信息。源站描述中关于主要衍生指标的句子未完整给出,因此无法确认该指标的完整定义、计算方式或质量水平。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、DOI、许可协议或使用条款。如需引用或使用该数据集,应访问来源站ebi.ac.uk获取正式信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-BIAD2452
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
S-BIAD2452 肾细胞癌中细胞周期相关蛋白的组织病理学与低多重免疫荧光数据集——韩国队列 2025-11-27 该数据集包含一个独立的韩国透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者队列,采集自首尔国立大学
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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