GSE277044:维持Cyclin D1表达使肾癌细胞不依赖HIF2
该数据集来自NCBI GEO,包含一项全基因组CRISPRa筛选研究,旨在识别在belzutifan工具化合物PT2399处理下赋予HIF2a依赖性ccRCC细胞耐药性的HIF2a响应基因

基本信息
资源简介
GSE277044:维持Cyclin D1表达使肾癌细胞不依赖HIF2
Sustaining Cyclin D1 Expression Renders Kidney Cancer Cells HIF2-Independent
该数据集来自NCBI GEO,包含一项全基因组CRISPRa筛选研究,旨在识别在belzutifan工具化合物PT2399处理下赋予HIF2a依赖性ccRCC细胞耐药性的HIF2a响应基因。研究发现维持CCND1表达可促进HIF2a非依赖性和belzutifan耐药,且该活性需要Cyclin D1激活Cdk4/6,但不仅限于pRB磷酸化。数据可用于研究肾癌HIF2a靶向治疗耐药机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):VHL抑癌基因失活稳定HIF2a,驱动透明细胞肾细胞癌(ccRCC)。HIF2a抑制剂belzutifan已获批用于ccRCC治疗,但原发性和获得性耐药常见。HIF2a与ARNT结合后转录激活数百个基因。我们在经belzutifan工具化合物PT2399处理的HIF2a依赖性ccRCC细胞系中进行了全基因组CRISPRa筛选,以鉴定在未下调时赋予belzutifan耐药性的HIF2a响应基因。维持HIF2a靶基因CCND1(编码Cyclin D1)的表达可促进HIF2a非依赖性/belzutifan耐药。该活性需要Cyclin D1激活Cdk4/6,但不仅限于对经典Cyclin D1靶点pRB的抑制性磷酸化。事实上,缺乏全部三个pRB家族成员的ccRCC细胞系仍至少部分依赖HIF2a。在此背景下。然而
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肾癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277044
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 10 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
VHL抑癌基因的失活可稳定HIF2α,进而驱动透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的发生。HIF2α抑制剂belzutifan已获批用于ccRCC治疗,但原发性和获得性耐药较为常见。HIF2α与ARNT结合后,可转录激活数百个基因。我们在经belzutifan工具化合物PT2399处理的HIF2α依赖性ccRCC细胞系中进行了全基因组CRISPRa筛选,以鉴定在未被下调时赋予belzutifan耐药性的HIF2α响应基因。维持HIF2α靶基因CCND1(编码Cyclin D1)的表达可促进HIF2α非依赖性/belzutifan耐药。该活性需要Cyclin D1对Cdk4/6的激活,但并非仅由Cyclin D1经典靶点pRB的抑制性磷酸化所致。事实上,缺乏全部三个pRB家族成员的ccRCC细胞系仍至少部分依赖HIF2α。然而,在此背景下,激酶缺陷型Cyclin D1变体至少部分逆转了belzutifan的抗增殖效应,提示Cyclin D1对ccRCC的促进作用需要pRB旁系同源蛋白的磷酸化以及一种或多种不依赖激酶的Cyclin D1活性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




