马兜铃酸相关肾细胞癌的肿瘤免疫微环境及免疫检查点阻断应答数据集

该数据集来自 NCBI GEO(GSE275422),包含 1 个表达谱芯片数据文件,针对马兜铃酸相关肾细胞癌的肿瘤免疫微环境及免疫检查点阻断应答开展研究

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL320699606
GSE275422: Aristolochic acid-related renal cell carcinoma exhibits a distinct tumor immune microenvironment and may be more responsive to immune checkpoint blockade

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-07

资源简介

马兜铃酸相关肾细胞癌的肿瘤免疫微环境及免疫检查点阻断应答数据集

Aristolochic acid-related renal cell carcinoma exhibits a distinct tumor immune microenvironment and may be more responsive to immune checkpoint blockade

该数据集来自 NCBI GEO(GSE275422),包含 1 个表达谱芯片数据文件,针对马兜铃酸相关肾细胞癌的肿瘤免疫微环境及免疫检查点阻断应答开展研究。数据覆盖 9606(人类)样本,基于 NanoString 基因表达 panel 进行功能通路分析,可识别不同免疫特征聚类,并评估肿瘤炎症签名与免疫细胞类型评分,用于探索马兜铃酸相关肾细胞癌对免疫检查点阻断的潜在预测生物标志物(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在探究马兜铃酸(AA)相关肾细胞癌(RCC)的免疫特征,并探索其作为免疫检查点阻断(ICB)预测生物标志物的潜在作用。通过 NanoString 基因表达 panel 进行功能通路分析,发现了三个不同的聚类。AA 阳性透明细胞肾细胞癌(ccRCC)构成了聚类 1 和聚类 3 的大部分,且两名对 ICB 应答良好的患者被归入聚类 3。聚类 3 表现出更高的肿瘤炎症签名(TIS)和免疫细胞类型评分。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL32069、9606。本站分类:肿瘤/肾癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275422

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 02 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究与AA相关的肾细胞癌(RCC)的免疫特征,并探索其作为ICB预测生物标志物的潜在作用。通过使用NanoString基因表达面板进行功能通路分析,发现了三个不同的聚类。AA阳性透明细胞肾细胞癌(ccRCC)构成了聚类1和聚类3的大部分,而对ICB反应良好的两名患者被归入聚类3。聚类3表现出更高的肿瘤炎症特征(TIS)和免疫细胞类型评分。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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