ANGPTL4通过抑制溶酶体酸性脂肪酶抑制透明细胞肾细胞癌

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE273236

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肾细胞癌（RCC）是肾癌最常见的类型，是一种异质性疾病，其中透明细胞肾细胞癌（ccRCC）是最常见且侵袭性最强的亚型。虽然大多数ccRCC肿瘤中血管生成素样蛋白4（ANGPTL4）的表达升高，但在我们的研究中，我们发现了一个显著的患者亚群，其肿瘤中ANGPTL4表达没有增加。与ANGPTL4高表达的患者相比，这些患者的预后更差。这些ANGPTL4低表达的癌症其特征是野生型Von Hippel-Lindau（wt VHL）基因频率增加——该基因在ccRCC中常发生突变——以及与脂质代谢相关基因的富集。利用携带野生型VHL的RCC肿瘤模型，我们证明ANGPTL4表现为一种肿瘤抑制因子。在ccRCC细胞系中，ANGPTL4的缺失以溶酶体酸性脂肪酶（LAL）依赖的方式导致肿瘤生长和集落形成增加，而表达N端ANGPTL4可挽救这一表型。在机制层面，ANGPTL4的缺失增加了ccRCC细胞中溶酶体酸性脂肪酶的活性。这些数据表明，ANGPTL4通过调控LAL活性在ccRCC中发挥其肿瘤抑制作用。

重要的是，所识别出的ANGPTL4低表达患者队列可能表现出对脂质代谢的更大依赖性，这可以作为未来治疗的一个靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。