BGN在ccRCC进展与转移机制研究数据集

该数据集来自NCBI GEO,聚焦BGN在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进展与转移中的机制研究。数据基于高通量测序表达谱,包含1个文件,可用于分析BGN在肾癌与正常组织中的表达差异、临床意义及与免疫细胞的关联,并支持差异基因分析、GO-KEGG与GSEA等下游分析,为探索BGN相关信号通路及ccRC

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时间序列分类GPL246769606
GSE264075: Study on the mechanism of BGN in progression and metastasis of ccRCC

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-07

资源简介

BGN在ccRCC进展与转移机制研究数据集

Study on the mechanism of BGN in progression and metastasis of ccRCC

该数据集来自NCBI GEO,聚焦BGN在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进展与转移中的机制研究。数据基于高通量测序表达谱,包含1个文件,可用于分析BGN在肾癌与正常组织中的表达差异、临床意义及与免疫细胞的关联,并支持差异基因分析、GO-KEGG与GSEA等下游分析,为探索BGN相关信号通路及ccRCC进展机制提供数据基础(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 16 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):基于多个公共数据库,我们研究了BGN在ccRCC中的表达水平、其临床意义及其与免疫细胞的关联。采用实时荧光定量PCR验证BGN在肿瘤与癌旁正常组织中的表达。通过RNA测序进行差异基因分析、GO-KEGG分析和GSEA分析,以阐明潜在的信号通路。通过慢病毒转染生成BGN敲低细胞,以检测BGN对ccRCC的影响。分别使用CCK8、集落形成、伤口愈合、Transwell迁移和侵袭实验评估细胞增殖、迁移和侵袭。结果:我们通过数据库分析和聚合酶链反应(PCR)发现,与正常组织相比,BGN在肾癌组织中的表达显著上调。进一步分析表明

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肾癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE264075

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

基于多个公共数据库,我们研究了BGN在ccRCC中的表达水平、其临床意义及其与免疫细胞的相关性。采用实时荧光定量PCR验证BGN在肿瘤及癌旁正常组织中的表达。通过RNA测序进行差异基因分析、GO-KEGG分析和GSEA分析,以阐明潜在的信号通路。通过慢病毒转染生成BGN敲低细胞,以研究BGN对ccRCC的影响。分别使用CCK8、集落形成、伤口愈合、Transwell迁移和侵袭实验评估细胞增殖、迁移和侵袭能力。结果:我们通过数据库分析和聚合酶链反应(PCR)发现,与正常组织相比,BGN在肾癌组织中的表达显著上调。进一步分析表明,BGN高表达与ccRCC进展和免疫浸润相关。体外实验证实,BGN沉默有效抑制了ccRCC的细胞增殖、迁移和侵袭。在机制上,这些效应可能通过MAPK信号通路介导。

结论:BGN可能在ccRCC的进展和转移中发挥关键作用,其作用可能通过MAPK信号通路介导。因此,BGN有望成为ccRCC的潜在治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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