GSE252629：载脂蛋白L1是透明细胞肾细胞癌转移中的抑癌基因 [miRNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252629

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数据说明

肾癌的5年生存率在发生转移时从93%急剧下降至15%。转移占肾癌病例的30%，其中透明细胞肾细胞癌（ccRCC）是最主要的亚型。通过对ccRCC患者样本的mRNA进行测序，我们发现载脂蛋白L1（APOL1）在肿瘤中的表达水平高于其邻近正常组织。该基因此前已在大量肾脏疾病研究中被识别，并据报道是多种癌症的潜在预后标志物。然而，APOL1在ccRCC中，尤其是在转移过程中的分子功能仍不清楚。在本研究中，我们调控了APOL1在多种肾癌细胞系中的表达，并分析了其增殖、迁移和侵袭特性。引人注目的是，APOL1过表达在体外和体内均抑制了ccRCC的转移。随后，我们通过研究其下游通路，探索了APOL1缓解ccRCC恶性进展的机制。APOL1过表达降低了黏着斑分子的活性、Akt信号通路的活性以及EMT过程。

此外，在上游机制中，我们发现miR-30a-3p能够抑制APOL1的表达。总之，我们的研究表明，APOL1在ccRCC中作为抑癌因子发挥作用并抑制转移，这可能为ccRCC患者提供新的潜在治疗途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。