BIGH3诱导骨细胞凋亡与缝隙连接失效促进ccRCC骨转移骨溶解
该数据集来自NCBI GEO,标题为BIGH3诱导骨细胞凋亡与缝隙连接失效促进透明细胞肾细胞癌(ccRCC)骨转移骨溶解

基本信息
资源简介
BIGH3诱导骨细胞凋亡与缝隙连接失效促进ccRCC骨转移骨溶解
BIGH3-induced Osteocyte Apoptosis and Gap Junction Failure Foster Osteolysis in Clear Cell Renal Cell Carcinoma (ccRCC) Bone Metastasis
该数据集来自NCBI GEO,标题为BIGH3诱导骨细胞凋亡与缝隙连接失效促进透明细胞肾细胞癌(ccRCC)骨转移骨溶解。数据包含1个文件GSE244453_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(GPL24247,10090)。源站描述涉及BIGH3通过诱导骨细胞凋亡、抑制缝隙连接蛋白Cx43表达与功能破坏骨稳态,以及溶酶体抑制剂(如HCQ和NH4Cl)在体外逆转缝隙连接功能障碍、在体内抑制肿瘤生长并逆转骨溶解的研究。该数据可用于肾癌骨转移相关基因表达分析及骨溶解机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):骨转移的进展涉及肿瘤细胞与成骨细胞、破骨细胞和骨细胞之间的相互作用。肾细胞癌骨转移(RCCBM)以溶骨性为主,且常对治疗耐药。我们此前报道,定植的786-O RCC细胞分泌的BIGH3(转化生长因子-β诱导蛋白ig-h3)抑制成骨细胞分化,从而促进骨内肿瘤进展。在此我们报道,BIGH3在人类标本和小鼠中均诱导骨细胞凋亡,并抑制缝隙连接(GJ)蛋白Cx43的表达和功能,破坏骨稳态。作为概念验证,溶酶体抑制剂如羟氯喹(HCQ)和NH4Cl在体外逆转了BIGH3介导的GJ功能障碍;并在体内抑制肿瘤生长并逆转Bo-786 RCC诱导的骨溶解。HCQ与CBZ联合而非单独使用,逆转了RCCBM介导的
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/肾癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244453
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 18 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
骨转移的进展涉及肿瘤细胞与成骨细胞、破骨细胞及骨细胞之间的相互作用。肾细胞癌骨转移(RCCBM)以溶骨性为主,且常对治疗耐药。我们此前报道,定植的786-O肾细胞癌细胞分泌的BIGH3(转化生长因子-β诱导蛋白ig-h3)通过抑制成骨细胞分化促进骨内肿瘤进展。本文报道,BIGH3在人类标本和小鼠中均诱导骨细胞凋亡,并抑制缝隙连接(GJ)蛋白Cx43的表达和功能,破坏骨稳态。作为概念验证,溶酶体抑制剂(如羟氯喹(HCQ)和NH4Cl)在体外逆转了BIGH3介导的GJ功能障碍;在体内抑制了肿瘤生长并逆转了Bo-786肾细胞癌诱导的骨溶解。HCQ联合CBZ(而非单用)可逆转RCCBM介导的骨密度和成骨细胞数量下降,并减少骨细胞凋亡和破骨细胞募集。这些BIGH3相关的对骨微环境的影响构成了一种非经典的转移进展机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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