肾髓质癌免疫治疗疗效激发研究 [RNA-seq II]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240827

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肾髓质癌（RMC）主要影响携带镰状细胞病（SCD）或镰状细胞贫血（SCA）等镰状血红蛋白病的非洲裔年轻个体。RMC对用于其他肾细胞癌的靶向治疗和免疫治疗策略均难治。我们已证实，尽管RMC具有炎症性肿瘤免疫微环境，但其对免疫检查点抑制仍具耐药性。因此，亟需新的治疗策略来逆转这种耐药性。我们发现，在SCD条件下，CD8+ T细胞表现出基因组结构改变和铁死亡，这显著损害了效应T细胞的抗肿瘤免疫。这些观察结果可能揭示了RMC对免疫检查点治疗具有独特耐药性背后的基本机制。通过利用小鼠SCD模型和表型上代表SCD/SCA的人源化小鼠，以及从SCA患者分离的原代CD8+ T细胞，我们发现SLC7A11基因在SCA供者的CD8+ T细胞中因基因组结构改变而发生转录下调。

SLC7A11表达降低通过损害胱氨酸转运和谷胱甘肽（GSH）合成，部分解释了SCD疾病中CD8+ T细胞所观察到的铁死亡。我们的研究结果还表明，使用硫化氢缓释供体治疗可恢复SLC7A11的表达，拮抗SCD/SDA条件下CD8+ T细胞的铁死亡，并在体内恢复抗肿瘤免疫。因此，我们的研究结果为SCD和RMC提供了新的机制见解，并为开发创新治疗策略以使RMC对免疫治疗敏感铺平了道路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。