透明细胞肾细胞癌 circSOD2 敲低组与阴性对照 miRNA 高通量测序数据集

数据可用于分析 circSOD2 下游潜在 miRNA 的表达变化,为非编码 RNA 调控机制研究提供基础(来源 NCBI)

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基因组预测GPL185739606
GSE199053: Clear Cell Renal Cell Carcinoma: high-throughput sequencing facilitates quantitative analysis of micro RNAs in the negative control and circSOD2-sh groups

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-07

资源简介

透明细胞肾细胞癌 circSOD2 敲低组与阴性对照 miRNA 高通量测序数据集

Clear Cell Renal Cell Carcinoma: high-throughput sequencing facilitates quantitative analysis of micro RNAs in the negative control and circSOD2-sh groups

该数据集来自 NCBI GEO(GSE199053),针对人透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中 circSOD2 敲低(circSOD2-sh)组与阴性对照组开展 miRNA 高通量测序,包含 4 个 circSOD2-sh 细胞样本及对应阴性对照样本,共 1 个数据文件(GSE199053_series_matrix.txt.gz)。数据可用于分析 circSOD2 下游潜在 miRNA 的表达变化,为非编码 RNA 调控机制研究提供基础(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):研究表明,环状 RNA(circRNA)在多种肿瘤进展中发挥关键作用,它们通常作为 microRNA(miRNA)的海绵调控下游基因表达。然而,circRNA 在人透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的具体功能与机制仍需进一步研究。既往研究已证实 circSOD2 在 ccRCC 中上调并发挥促进肿瘤进展的作用。为明确 circSOD2 的潜在下游 miRNA,制备了 4 个 circSOD2-sh ccRCC 细胞样本及相应阴性对照样本,并进行了 miRNA 测序。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/肾癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199053

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

研究表明,环状RNA(circRNAs)在多种肿瘤进展中发挥关键作用,它们通常作为microRNA(miRNA)的海绵,调控下游基因的表达。然而,circRNAs在人透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的具体功能和机制仍需进一步研究。既往研究已证实circSOD2在ccRCC中表达上调,并发挥促进肿瘤进展的作用。为明确验证circSOD2潜在的下游miRNA,制备了4个circSOD2-sh ccRCC细胞样本及相应的阴性对照样本,并进行了miRNA测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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