透明细胞肾细胞癌 circSOD2 敲低组与阴性对照 miRNA 高通量测序数据集
数据可用于分析 circSOD2 下游潜在 miRNA 的表达变化,为非编码 RNA 调控机制研究提供基础(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
透明细胞肾细胞癌 circSOD2 敲低组与阴性对照 miRNA 高通量测序数据集
Clear Cell Renal Cell Carcinoma: high-throughput sequencing facilitates quantitative analysis of micro RNAs in the negative control and circSOD2-sh groups
该数据集来自 NCBI GEO(GSE199053),针对人透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中 circSOD2 敲低(circSOD2-sh)组与阴性对照组开展 miRNA 高通量测序,包含 4 个 circSOD2-sh 细胞样本及对应阴性对照样本,共 1 个数据文件(GSE199053_series_matrix.txt.gz)。数据可用于分析 circSOD2 下游潜在 miRNA 的表达变化,为非编码 RNA 调控机制研究提供基础(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 21 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):研究表明,环状 RNA(circRNA)在多种肿瘤进展中发挥关键作用,它们通常作为 microRNA(miRNA)的海绵调控下游基因表达。然而,circRNA 在人透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的具体功能与机制仍需进一步研究。既往研究已证实 circSOD2 在 ccRCC 中上调并发挥促进肿瘤进展的作用。为明确 circSOD2 的潜在下游 miRNA,制备了 4 个 circSOD2-sh ccRCC 细胞样本及相应阴性对照样本,并进行了 miRNA 测序。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/肾癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199053
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
研究表明,环状RNA(circRNAs)在多种肿瘤进展中发挥关键作用,它们通常作为microRNA(miRNA)的海绵,调控下游基因的表达。然而,circRNAs在人透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的具体功能和机制仍需进一步研究。既往研究已证实circSOD2在ccRCC中表达上调,并发挥促进肿瘤进展的作用。为明确验证circSOD2潜在的下游miRNA,制备了4个circSOD2-sh ccRCC细胞样本及相应的阴性对照样本,并进行了miRNA测序。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




