肾细胞癌中JMJD1A和JMJD2B靶基因的鉴定

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167025

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

缺氧诱导因子能诱导组蛋白去甲基化酶JMJD1A (KDM3A)和JMJD2B (KDM4B)的表达，将缺氧的肿瘤微环境与可能促进肿瘤进展的表观遗传机制联系起来。通过转录谱分析，我们确定了在RCC4细胞中，通过siRNA介导敲低JMJD1A和JMJD2B后受到调控的基因。此数据集包含了来自肾细胞癌的表达数据，这些数据是在von Hippel-Lindau (VHL)抑癌基因缺失或突变的情况下，结合siRNA介导的组蛋白去甲基化酶JMJD1A和JMJD2B敲低所获得的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。