GSE100107：长链非编码RNA HOTAIR通过上调IGFBP2促进肾细胞癌细胞迁移

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE100107

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数据说明

肾细胞癌（RCC）是最致命的泌尿系统癌症之一。约三分之一的RCC患者在诊断时已有远处转移。越来越多的证据表明，Hox反义基因间RNA（HOTAIR）在多种癌症的转移中发挥重要作用。然而，HOTAIR增强恶性肿瘤的确切机制尚不清楚，尤其是在RCC中。在此，我们证明了HOTAIR通过调控胰岛素样生长因子结合蛋白2（IGFBP2）的表达来增强RCC细胞的迁移能力。肿瘤中HOTAIR的表达与核分级、淋巴结转移和肺转移显著相关。在我们的数据集和癌症基因组图谱数据集中，HOTAIR高表达均与不良预后相关。在RCC细胞系中，迁移能力以HOTAIR依赖的方式增强。HOTAIR过表达加速了免疫缺陷小鼠中的致瘤性和肺转移。微阵列分析显示，与对照细胞相比，HOTAIR过表达细胞中IGFBP2表达上调。通过敲低IGFBP2，HOTAIR过表达细胞增强的迁移活性被减弱。

IGFBP2与HOTAIR在临床肾细胞癌样本中共表达。我们的研究结果表明，HOTAIR-IGFBP2轴在肾细胞癌转移中起着关键作用，并可能成为晚期肾细胞癌的新治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。