GDC TARGET-RT:横纹肌样瘤

数据包含 69 例病例、1,129 个文件,总大小 44709.4 GB,提供临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据,并区分开放与受控访问层级

gdc
浏览 13
基因组分类Complex Mixed and Stromal Neoplasms
GDC TARGET-RT: Rhabdoid Tumor

基本信息

模态
基因组
大小
48006.365141384 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

GDC TARGET-RT:横纹肌样瘤

该数据集来自 GDC 的 TARGET-RT 项目,聚焦横纹肌样瘤(Rhabdoid Tumor),原发部位涵盖肝脏及肝内胆管、唇和肾脏,疾病类型为 Complex Mixed and Stromal Neoplasms。数据包含 69 例病例、1,129 个文件,总大小 44709.4 GB,提供临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据,并区分开放与受控访问层级。可用于肿瘤分类、基因组变异分析、甲基化模式研究及多模态数据整合等任务(来源 portal.gdc.cancer.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):GDC 项目 TARGET-RT(横纹肌样瘤)。原发部位:肝脏及肝内胆管、唇、肾脏。疾病类型:Complex Mixed and Stromal Neoplasms。项目:TARGET。病例数:69。文件数:1,129。总大小:44709.4 GB。NCI Genomic Data Commons 协调的癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。

【主题与分类】

主题标签:Complex Mixed and Stromal Neoplasms。本站分类:肿瘤/肾癌。

【获取与许可】

源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-RT

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源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-RT

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 48006.37 GB。

数据说明

GDC project TARGET-RT (Rhabdoid Tumor). Primary site: Liver and intrahepatic bile ducts, Lip, Kidney. Disease type: Complex Mixed and Stromal Neoplasms. Program: TARGET. Cases: 69. Files: 1,129. Total size: 44709.4 GB. NCI Genomic Data Commons harmonized cancer genomics project (clinical, biospecimen, RNA-Seq, WXS, methylation and imaging data; open and controlled access tiers).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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