GDC TARGET-RT:横纹肌样瘤
数据包含 69 例病例、1,129 个文件,总大小 44709.4 GB,提供临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据,并区分开放与受控访问层级

基本信息
资源简介
GDC TARGET-RT:横纹肌样瘤
该数据集来自 GDC 的 TARGET-RT 项目,聚焦横纹肌样瘤(Rhabdoid Tumor),原发部位涵盖肝脏及肝内胆管、唇和肾脏,疾病类型为 Complex Mixed and Stromal Neoplasms。数据包含 69 例病例、1,129 个文件,总大小 44709.4 GB,提供临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据,并区分开放与受控访问层级。可用于肿瘤分类、基因组变异分析、甲基化模式研究及多模态数据整合等任务(来源 portal.gdc.cancer.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):GDC 项目 TARGET-RT(横纹肌样瘤)。原发部位:肝脏及肝内胆管、唇、肾脏。疾病类型:Complex Mixed and Stromal Neoplasms。项目:TARGET。病例数:69。文件数:1,129。总大小:44709.4 GB。NCI Genomic Data Commons 协调的癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。
【主题与分类】
主题标签:Complex Mixed and Stromal Neoplasms。本站分类:肿瘤/肾癌。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-RT
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-RT
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 48006.37 GB。
数据说明
GDC project TARGET-RT (Rhabdoid Tumor). Primary site: Liver and intrahepatic bile ducts, Lip, Kidney. Disease type: Complex Mixed and Stromal Neoplasms. Program: TARGET. Cases: 69. Files: 1,129. Total size: 44709.4 GB. NCI Genomic Data Commons harmonized cancer genomics project (clinical, biospecimen, RNA-Seq, WXS, methylation and imaging data; open and controlled access tiers).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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