GDC TARGET-CCSK:肾透明细胞肉瘤
数据涵盖临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化及影像等多组学信息,包含开放与受控访问层级,共 13 例病例、185 个文件,总大小约 465.8 GB

基本信息
资源简介
GDC TARGET-CCSK:肾透明细胞肉瘤
该数据集来自 NCI Genomic Data Commons 的 TARGET 计划,聚焦肾透明细胞肉瘤(Clear Cell Sarcoma of the Kidney),原发部位为肾脏,疾病类型属 Complex Mixed and Stromal Neoplasms。数据涵盖临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化及影像等多组学信息,包含开放与受控访问层级,共 13 例病例、185 个文件,总大小约 465.8 GB。可用于肾透明细胞肉瘤的分子特征分析、分型建模及多模态研究(来源 portal.gdc.cancer.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):GDC 项目 TARGET-CCSK(肾透明细胞肉瘤)。原发部位:肾脏。疾病类型:Complex Mixed and Stromal Neoplasms。计划:TARGET。病例数:13。文件数:185。总大小:465.8 GB。NCI Genomic Data Commons 协调的癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。
【主题与分类】
主题标签:Complex Mixed and Stromal Neoplasms。本站分类:肿瘤/肾癌。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-CCSK
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-CCSK
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 500.17 GB。
数据说明
GDC项目TARGET-CCSK(肾透明细胞肉瘤)。原发部位:肾脏。疾病类型:复杂混合性和间质性肿瘤。项目:TARGET。病例数:13。文件数:185。总大小:465.8 GB。NCI基因组数据共享中心整合的癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA测序、全外显子组测序、甲基化及影像数据;开放与受控访问层级)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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