PTTG1 表达与侵袭性透明细胞肾细胞癌相关

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-25399

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数据说明

垂体瘤转化基因（PTTG1）是近期发现的一种癌基因，与多种肿瘤的恶性进展有关。它已被证实能驱动内分泌和非内分泌恶性肿瘤的发展，但尚未在肾细胞癌背景下进行研究。此处我们展示PTTG1在透明细胞肾细胞癌——最常见的肾癌类型中频繁扩增并过度表达。透明细胞肾细胞癌（ccRCC）在细胞遗传学上的特征为3号染色体短臂缺失，该区域包含von-Hippel Lindau抑癌基因，以及5号染色体长臂的扩增。5号染色体拷贝数增加的意义至今仍是个谜，但推测该区域含有在ccRCC发生或进展中起重要作用的癌基因。PTTG1癌基因定位于5号染色体长臂，在透明细胞肾细胞癌中显示出频繁的拷贝数增加，并且相对于邻近正常肾脏组织，在肿瘤组织中显著过度表达。此外，我们已经确立了PTTG1在ccRCC肿瘤发生和进展中的功能作用。

PTTG1敲除显著降低了ccRCC细胞在体外和体内的致瘤能力以及这些细胞在体外的侵袭能力。对PTTG1调控靶点的分析支持其在一局限性ccRCC向侵袭性和转移性疾病进展中的作用，这一观点进一步得到PTTG1与高级别和高分期肿瘤的临床相关性及其与不良预后关联的证实。在多种ccRCC细胞系中观察到PTTG1依赖性的Rho-GEF ECT2（另一种原癌基因）过表达，且ECT2过表达与PTTG1过表达、高分期、高级别及人类ccRCC肿瘤不良预后相关。由于GEF已被推崇为靶向癌症治疗的可行药物靶点，PTTG1与ECT2癌基因之间的关系或许能够被利用来治疗该疾病。74例ccRCC和16例正常肾组织的SNP数据

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。