透明细胞肾细胞癌肺转移灶表达数据
该数据集来自 omicsdi.org,收录透明细胞肾细胞癌肺转移灶的转录组表达数据,覆盖 20 例肺转移样本。研究分析全转录组表达谱,旨在识别与肾细胞癌两个重要预后因素相关的表达模式:肾切除术后无病间期(DFI)以及每位患者的转移灶数量

基本信息
资源简介
透明细胞肾细胞癌肺转移灶表达数据
该数据集为透明细胞肾细胞癌肺转移灶的表达谱数据,英文名称为 Expression data from pulmonary metastases of clear-cell renal cell carcinoma,来源于 omicsdi.org,在站内归入肿瘤 / 肾癌分类,主题标签为 Transcriptomics。数据集收录了 20 例肾细胞癌肺转移样本的全转录组表达谱,研究目的在于识别与肾细胞癌两个重要预后因素相关的表达模式,即肾切除术后无病间期(DFI)以及每位患者的转移灶数量。整体来看,该数据集围绕转移灶的分子特征展开,适合用于探索与转移发生时间及转移负荷相关的转录组信号。
【数据集背景】
源站描述指出,目前对转移扩散的理解仍然有限,导致转移灶特定特征的分子机制在很大程度上仍属未知,这些特征包括源自同一原发肿瘤实体的转移灶具有不同的休眠期,以及同一原发肿瘤患者出现不同数量的转移灶。了解这些现象的分子基础,将有助于判断患者预后,并促进选择适当的治疗方案。基于这一背景,该研究对肾细胞癌肺转移灶的转录组表达谱进行分析,以期找到与预后因素相关的表达模式。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 20 例肾细胞癌肺转移灶的全转录组表达谱。研究关注的两个临床特征为肾切除术后无病间期(DFI)和每位患者的转移灶数量。源站描述中的关键词表明,该数据集用于比较来自具有不同临床特征患者的肺转移灶,这些转移灶在肾切除术后早期或晚期出现。主题标签为 Transcriptomics,表明数据属于转录组学范畴。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,站内分类为肿瘤 / 肾癌。源站描述说明了样本类型为肾细胞癌的肺转移灶,样本数量为 20 例,并围绕肾切除术后无病间期和每位患者转移灶数量这两个预后因素组织研究。除上述信息外,源站未提供更详细的采集地点、时间范围或平台信息。
【适用场景】
该数据集适用于研究肾细胞癌肺转移的转录组特征,尤其是探索与转移灶出现时间(早期或晚期)以及转移灶数量相关的表达模式。由于研究聚焦于肾切除术后无病间期和每位患者转移灶数量这两个预后因素,该数据可用于比较不同临床特征患者之间的全转录组表达差异,为理解转移扩散的分子基础、预后判断及治疗决策提供数据支持。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。使用者可依据数据集所包含的 20 例肺转移灶转录组表达谱,结合肾切除术后无病间期和每位患者转移灶数量这两个临床特征进行分组比较分析。具体分析流程、标准化方式及统计方法需参考源站提供的原始说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本纳入标准、平台信息或技术验证的详细说明。已知样本量为 20 例肺转移灶,研究关注的两个预后因素为肾切除术后无病间期和每位患者转移灶数量。由于源站描述未涉及数据质量控制、批次效应或验证实验等内容,使用时应结合原始数据说明进行评估。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-14378
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对转移扩散的理解仍然有限,导致转移特定特征的分子机制在很大程度上仍不清楚,例如源自同一原发肿瘤实体的转移灶具有不同的休眠期,或同一原发肿瘤患者中转移灶数量存在差异。了解这些现象的分子基础将有助于预测患者预后,并为选择合适的治疗方案提供依据。我们分析了20例肾细胞癌肺转移灶的全转录组表达谱,以识别与RCC中两个重要预后因素相关的表达模式:肾切除术后的无病间期(DFI)以及每位患者的转移灶数量。关键词:不同临床特征患者的肺转移灶比较——肾切除术后早期或晚期出现的转移灶(DFI≤9个月 vs. ≥60个月);来自仅有少量或多发肺转移灶患者的转移灶(≤8个 vs. ≥16个)
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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