肾细胞癌比较定量蛋白质组学鉴定新进展因子
主题标签：肾细胞癌、定量蛋白质组学、肿瘤进展因子、PRIDE、肾癌。本数据集为肿瘤领域公开数据集，主题涵盖肾细胞癌。本数据集为肿瘤领域的基因组公开数据集，来源：google_dataset，主题涵盖肾细胞癌。
基本信息
资源简介
肾细胞癌比较定量蛋白质组学鉴定新进展因子
Comparative quantitative proteomics in renal cell carcinoma to identify the novel progression factors 是一个面向肿瘤研究领域的公开数据集，主题聚焦于肾细胞癌（肾癌）的定量蛋白质组学研究。该数据集由 Ann-Yae Na 于 2024 年发布，收录于 EBI（欧洲生物信息学研究所）的 PRIDE 蛋白质组学数据存档平台，项目编号为 PXD039204。从主题定位看，该数据集围绕肾细胞癌的进展因子展开比较定量蛋白质组学分析，旨在通过蛋白质层面的定量比较，识别与肿瘤进展相关的新型因子。其内容属于肿瘤学与肾脏肿瘤研究的交叉方向，适合关注肾癌分子机制、蛋白质组学方法及肿瘤进展标志物研究的科研人员参考使用。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面对该数据集作进一步介绍。
【数据集背景】
肾细胞癌是肾脏最常见的恶性肿瘤类型之一，其发生与进展涉及复杂的分子改变。蛋白质作为基因表达的最终功能执行者，其丰度变化往往直接反映肿瘤细胞的生理状态与恶性程度。定量蛋白质组学技术能够在整体水平上比较不同样本间蛋白质表达差异，因而成为寻找肿瘤进展相关因子的重要手段。该数据集正是以“比较定量蛋白质组学”为技术路线，以“识别新型进展因子”为研究目标而构建的肾细胞癌数据集，属于肿瘤学领域中肾癌方向的公开数据资源。
【数据内容】
该数据集的主题涵盖肾细胞癌、定量蛋白质组学、肿瘤进展因子等关键词，其核心内容为肾细胞癌相关的比较定量蛋白质组学数据。数据以蛋白质组学实验结果的形式组织，服务于肿瘤进展因子的筛选与鉴定。关于样本数量、分组设计、鉴定到的蛋白质数目、差异表达蛋白列表等具体内容细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 EBI 的 PRIDE 蛋白质组学数据存档平台，项目访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039204，发布者为 Ann-Yae Na，发布年份为 2024 年。数据通过 PRIDE 平台对外公开，属于蛋白质组学领域常见的公开数据共享形式。关于具体的样本采集流程、实验处理步骤与仪器参数等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题定位，该数据集可适用于肾细胞癌分子机制研究、肿瘤进展相关蛋白因子的筛选与验证、定量蛋白质组学分析方法的参考对照，以及肾癌生物标志物探索等研究方向。研究人员可将其作为肾癌蛋白质组学研究的公开数据资源，用于差异表达分析、候选因子挖掘或与其他肾癌组学数据的整合比较。关于该数据集在具体研究中的验证性应用案例，源站未提供。
【使用方法】
该数据集托管于 PRIDE 平台，通常可通过项目编号 PXD039204 在平台中检索并获取。使用者可依据 PRIDE 平台的一般数据访问方式下载数据文件，并结合蛋白质组学常用分析工具开展定量比较与差异分析。关于该数据集的具体文件组成、推荐分析流程与参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 PRIDE 平台收录的公开蛋白质组学数据集，其数据组织遵循该平台的共享规范。需要说明的是，数据集的研究结论与生物学意义应以原始研究文献为准；关于数据集的样本规模、技术重复、质控指标及潜在偏倚等质量相关信息，源站未提供。使用者在使用时应结合自身研究目的审慎评估数据的适用性。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参考源站给出的引用信息：Ann-Yae Na (2024). Comparative quantitative proteomics in renal cell carcinoma to identify the novel progression factors [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039204。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039204
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Ann-Yae Na (2024). Comparative quantitative proteomics in renal cell carcinoma to identify the novel progression factors [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039204
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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