透明细胞肾细胞癌整合代谢图谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-74734

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞代谢的变化促进肿瘤的发生和发展，并可使肿瘤易于受到干预。然而，由于检测和量化小分子的技术挑战、代谢途径的高度互联性，以及缺乏将代谢组学与其他组学数据分析和整合的专用工具，人类癌症代谢的研究仍然有限。我们的研究产生了针对单一癌症类型的最大综合代谢组学数据集，并在代谢组学与测序数据的整合方面取得了重大进展。我们的结果强调了随着肿瘤进展和获得更具侵袭性特征，细胞代谢发生了大规模重组。我们的工作成果通过一个面向癌症研究界的交互式公共数据门户提供。来自人类ccRCC肿瘤的10个RNA样本在高谷胱甘肽簇中进行了分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。