10x Visium空间转录组数据集：包含三级淋巴结构的肾癌（3例）与肺癌（5例）

资源简介

该数据集是一个公开的医学研究数据集，包含来自苏黎世大学医院病理研究所的肾癌（3例）和肺癌（5例）肿瘤样本的空间转录组数据，重点关注肿瘤中的三级淋巴结构（TLS）。数据包括经福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的5微米厚组织切片，使用10x Genomics Visium平台和人类探针集v1进行空间转录组测序，并辅以苏木精-伊红（H&E）染色图像。测序在Illumina NovaSeq 6000平台上完成，使用Space Ranger v2.1.0进行初步处理。数据包含原始及过滤后的基因表达矩阵、空间位置信息、预处理后的AnnData对象以及高分辨率组织图像。专家对H&E图像中的Visium点进行了手动注释，标签包括TLS、免疫、肿瘤、正常和未分配。该数据集主要用于研究肿瘤免疫微环境、三级淋巴结构的空间分布与功能，以及空间转录组学在癌症研究中的应用。