卡波西肉瘤原发患者样本

资源简介

该数据集是一个针对卡波西肉瘤（Kaposi Sarcoma, KS）的单细胞RNA测序数据集。卡波西肉瘤是一种由卡波西肉瘤相关疱疹病毒8型（KSHV）引起的复杂肿瘤。数据集包含来自16名受试者的25个皮肤和血液样本，通过单细胞RNA测序分析，旨在阐明KS肿瘤中受感染和未受感染的细胞类型。研究识别出两个KSHV感染细胞群：一个是CD34阴性的增殖性内皮细胞亚群，另一个是表达内皮基因的CD34阳性细胞，这些细胞存在于多种细胞类型中，如高内皮小静脉、有孔毛细血管和内皮尖端细胞。分析还发现了KSHV感染细胞中的新型细胞生物标志物（如钠通道SCN9A），并揭示KSHV阳性细胞在所有样本中占总肿瘤细胞的比例低于10%，且与肿瘤浸润免疫细胞数量呈负相关。此外，数据集还记录了KS肿瘤在抗逆转录病毒治疗或免疫治疗后细胞组成的变化，以及肿瘤和血液中T细胞受体克隆的扩增情况。该数据集为研究卡波西肉瘤的病理机制、识别预后和预测性生物标志物提供了重要资源，适用于肿瘤学、病毒学和免疫学等研究方向。