GSE3971 乳腺浸润性小叶癌与导管癌数据集
包含乳腺浸润性小叶癌和导管癌表达谱数据,用于组织学亚型比较分析。来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
GSE3971 乳腺浸润性小叶癌与导管癌数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Invasive lobular and ductal carcinomas of the breast》。源站首次发布:Jan 04 200。
【数据内容】
源站原始描述:This set of experiments includes 38 IDCs, 21 ILCs, 2 lymphnode metastases, and 3 normal breast samples. It is designed to compare gene expression profiles of IDCs and ILCs. Total RNAs from all samples were isolated using TRIzol, amplified using optimized T7 linear amplification protocol, and labeled with Cy5. Stratagen Universal Human Reference RNA was amplified the same way and labeled with Cy3
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1282、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE3971
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 18 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE3971
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- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含乳腺浸润性小叶癌和导管癌表达谱数据,用于组织学亚型比较分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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