霍奇金淋巴瘤治疗失败的循环基因组决定因素
经典霍奇金淋巴瘤（cHL）患者血浆与肿瘤标本的多组学基因组数据集，用于研究治疗失败的决定因素、亚型鉴定及ctDNA临床价值。
基本信息
模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-08
版本
v1
资源简介
该数据集包含366例经典霍奇金淋巴瘤（cHL）患者的血浆和肿瘤标本的多种基因组测序数据，包括靶向基因分型、全外显子测序、基于cfDNA片段特征的表观遗传表达推断（EPIC-Seq）、ctDNA治疗中追踪、RNA测序以及PhasED-Seq。研究揭示了cHL的两种基因组亚型及其临床预后相关性，发现IL4R截断突变及其治疗靶向潜力，并验证了治疗前后ctDNA水平在风险分层和检测影像学隐匿性微小残留病中的临床价值。患者来自2011-2020年间欧洲和北美的3个癌症中心和6个临床试验队列。
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs003435.v1.p1
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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