PRJDB16238：基于基因组分析阐明肺癌发生与进展的分子机制
本项目的目标是在体细胞层面分析人类肺癌细胞中的基因组异常和基因表达变化，例如突变、缺失、扩增和超甲基化，并将这些变化与临床病理信息进行对照，以从遗传层面阐明肺癌发生与进展的分子机制和特征
基本信息
资源简介
PRJDB16238：基于基因组分析阐明肺癌发生与进展的分子机制
PRJDB16238 是一个聚焦于肺癌分子机制解析的基因组学研究项目，其英文全称为“Elucidation of molecular mechanisms of lung cancer development and progression based on genome analysis”。该项目旨在从体细胞层面系统分析人类肺癌细胞中的基因组异常与基因表达变化，涵盖突变、缺失、扩增以及超甲基化等多种变异类型，并将这些分子层面的改变与临床病理信息进行对照，从而在遗传层面阐明肺癌发生与进展的分子机制及其特征。该数据集在分类上归属于肿瘤领域下的肺癌方向，来源站点为 ebi.ac.uk，属于面向人类肺癌基因组分析的研究型数据资源，适用于探索肺癌发生发展相关遗传变异的科研场景。
【数据集背景】
肺癌的发生与进展涉及复杂的基因组层面改变。为从遗传层面揭示其分子机制，该项目以人类肺癌细胞为研究对象，在体细胞层面开展基因组异常与基因表达变化的分析工作。研究关注的具体变异类型包括突变、缺失、扩增和超甲基化等，并强调将这些基因组层面的发现与临床病理信息进行对照，以期阐明肺癌发生与进展的分子机制和特征。该项目所涉及的个人数据依据 NBDC 人类数据共享指南获得发布批准，对应的 NBDC 研究编号为 hum0414，申请编号为 J-DS000809-001，批准机构为日本国家生物科学数据库中心（NBDC）的数据访问委员会。
【数据内容】
该数据集的内容围绕人类肺癌细胞的基因组异常与基因表达变化展开，具体涵盖突变、缺失、扩增和超甲基化等类型的基因组改变。研究在体细胞层面进行分析，并将上述基因组变异与临床病理信息进行对照。关于数据的具体样本量、变异位点数量、基因列表、表达谱矩阵等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。项目针对人类肺癌细胞，在体细胞层面采集基因组异常和基因表达变化相关信息，包括突变、缺失、扩增和超甲基化等。数据涉及个人数据，其发布已依据 NBDC 人类数据共享指南获得 NBDC 数据访问委员会批准，对应 NBDC 研究编号 hum0414 和申请编号 J-DS000809-001。关于具体的样本采集地点、采集时间、测序平台、样本处理流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌发生与进展分子机制相关的研究场景，尤其是从遗传层面探索基因组异常与基因表达变化的工作。具体可服务于对突变、缺失、扩增和超甲基化等变异类型的分析，以及将基因组改变与临床病理信息进行对照的研究需求。其目标在于阐明肺癌发生与进展的分子机制和特征。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
关于该数据集的具体使用方法、数据格式、访问方式、下载途径及分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集涉及个人数据，其发布已按照 NBDC 人类数据共享指南获得 NBDC 数据访问委员会批准，研究编号为 hum0414，申请编号为 J-DS000809-001。关于数据质量评估指标、覆盖度、准确性、完整性以及使用限制等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集涉及的个人数据依据 NBDC 人类数据共享指南发布，相关指南链接为 https://humandbs.biosciencedbc.jp/en/guidelines/data-sharing-guidelines，对应的 NBDC 研究编号为 hum0414，申请编号为 J-DS000809-001。关于具体的引用格式、许可条款细节及使用条件，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB16238
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目的目标是分析人肺癌细胞在体细胞水平上的基因组异常和基因表达变化，例如突变、缺失、扩增和超甲基化，并将其与临床病理学信息进行对比，以在遗传水平阐明肺癌发生和发展的分子机制与特征。National Bioscience Database Center (NBDC) 的数据访问委员会批准根据 NBDC Guidelines for Human Data Sharing (https://humandbs.biosciencedbc.jp/en/guidelines/data-sharing-guidelines) 公开这些个人数据，NBDC Research ID 为 hum0414，申请 ID 为 J-DS000809-001。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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