HepG2细胞FAM50A急性降解后GLORI-seq单碱基分辨率m6A图谱

该数据集来自HepG2细胞,在FAM50A-dTAG细胞中用DMSO或dTAG-13处理6小时后进行GLORI-seq,以单碱基分辨率量化全转录组m6A

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基因组回归GPL342849606
GSE344149: Single-base-resolution m6A profiling by GLORI-seq following acute FAM50A degradation in HepG2 cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

HepG2细胞FAM50A急性降解后GLORI-seq单碱基分辨率m6A图谱

Single-base-resolution m6A profiling by GLORI-seq following acute FAM50A degradation in HepG2 cells

该数据集来自HepG2细胞,在FAM50A-dTAG细胞中用DMSO或dTAG-13处理6小时后进行GLORI-seq,以单碱基分辨率量化全转录组m6A。每种条件包含两个生物学重复,每个文库分两个技术批次run207和run213测序。处理文件提供样本水平m6A比率、位点水平计数及配对差异统计。可用于研究FAM50A急性降解对m6A修饰的影响,并支持差异甲基化分析与位点水平回归建模(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 18 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在FAM50A-dTAG HepG2细胞中,用DMSO或dTAG-13处理6小时后进行GLORI-seq,以单碱基分辨率量化全转录组m6A。该数据集每种条件包含两个生物学重复。每个生物学文库分两个技术批次测序,即run207和run213。处理文件提供样本水平m6A比率、位点水平计数和配对差异统计。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肝细胞癌(HCC)。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344149

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 13 202,引用时请注意版本时效。

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数据说明

在经DMSO或dTAG-13处理6小时的FAM50A-dTAG HepG2细胞中进行了GLORI-seq,以单碱基分辨率量化全转录组m6A。该数据集每种条件包含两个生物学重复。每个生物学文库在两次技术运行中测序,即run207和run213。处理后文件提供了样本水平的m6A比率、位点水平的计数以及配对差异统计。

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