NSUN6敲低HepG2细胞的转录组范围M5C甲基化图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE303245

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了NSUN6在HepG2细胞RNA 5-甲基胞嘧啶（M5C）甲基化中的作用。通过shRNA介导的RNA干扰技术，构建了稳定的NSUN6敲低细胞系，并经qRT-PCR和Western blot验证。从敲低和对照细胞中提取RNA，用亚硫酸氢盐处理以转化未甲基化的胞嘧啶，并进行测序。测序数据比对到人类基因组（GRCh38），以识别M5C甲基化位点。通过比较NSUN6敲低与对照细胞间的甲基化水平，我们旨在绘制NSUN6依赖的M5C位点图谱，并阐明其在调控基因表达和细胞功能中的作用。该数据集为RNA修饰的表观遗传调控及NSUN6在人类细胞中的特定贡献提供了宝贵见解，对理解疾病机制具有潜在意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。