IDC MRI-DIR 数据集
IDC MRI-DIR 是来自影像数据共享平台 IDC 的 MRI 可变形图像配准数据集,属于肿瘤/头颈部癌分类,包含 9 名受试者

基本信息
资源简介
IDC MRI-DIR 数据集
IDC MRI-DIR 是来自影像数据共享平台 IDC 的 MRI 可变形图像配准数据集,属于肿瘤/头颈部癌分类,包含 9 名受试者。数据由两套图像集构成:一套是猪体模在四种压缩位置下的 CT、T1 和 T2 加权图像,体模中植入的金标在 CT 上可见而 MR 上不可见,可作为不干扰 MR-to-MR 配准的真值标志点;另一套是来自 28 名头颈部鳞状细胞癌患者的合成头颈图像,覆盖放疗前、中、后。该数据集可用于测量 MRI 可变形图像配准精度(来源 portal.imaging.datacommons.cancer.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):IDC collection MRI-DIR。癌症类型:头颈部鳞状细胞癌。肿瘤位置:Head-Neck、Phantom。受试者:9。构建了两套图像集以测量 MRI 中可变形图像配准的精度:一套是猪体模被压缩到四个不同位置时的 CT、T1 和 T2 加权图像,另一套是来自 28 名头颈部鳞状细胞癌患者的合成头颈图像,这些患者在放疗前、放疗期间和放疗后接受了扫描。植入体模的金标在 CT 上可见,但在 MR 上不可见,因此它们提供了真值标志点,且不会干扰 MR-to-MR 配准。请查看 MRI-DIR( collection 的任何支持性元数据。
【主题与分类】
主题标签:Head and Neck Squamous Cell Carcinoma、Head-Neck, Phantom。本站分类:肿瘤/头颈部癌。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=mri_dir
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=mri_dir
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDC 数据集 MRI-DIR。癌症类型:头颈部鳞状细胞癌。肿瘤位置:头颈部、体模。受试者:9。构建了两组图像集,用于测量 MRI 中可变形图像配准的准确性:将猪体模压缩至四个不同位置后采集的 CT、T1 和 T2 加权图像,以及来自 28 名头颈部鳞状细胞癌患者的合成头颈部图像,这些患者在放疗前、放疗期间和放疗后接受了扫描。植入体模的金标记物在 CT 上可见,但在 MR 上不可见,因此它们提供了真值标志点,且不会干扰 MR 到 MR 的配准。请参阅 MRI-DIR(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2018.3f08iejt)页面,以了解有关这些图像的更多信息并获取该数据集的任何支持性元数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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