空间IDH突变胶质瘤Visium数据集

该数据集是一个包含胶质母细胞瘤(GBM)和IDH突变胶质瘤样本的空间转录组学数据集,数据模态为Visium平台生成的空间基因表达矩阵,整合了来自多项研究的多中心样本,主要用于研究胶质瘤微环境的时空异质性、肿瘤细胞的空间组织模式以及IDH突变状态对肿瘤生态系统的影响,为神经肿瘤的精准治疗和机制探索提供空间多组学数据支持。

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Zenodo
2026-02-01 更新
浏览 32
分类空间转录组学胶质瘤微环境分析
Spatial IDH-mut glioma Visium dataset

基本信息

大小
3.84 GB
任务类型
分类
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2026-02-01

资源简介

空间IDH突变胶质瘤Visium数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Spatial IDH-mut glioma Visium dataset》。源站首次发布:2026-03-01。

【数据内容】

源站原始描述:This repository provides original Visium data of GBM and IDHmut glioma samples used in Hoefflin, Greenwald, Galili Darnell, Mount, et al. "Spatial analysis reveals the evolving organization of low-grade and high-grade IDH-mutant glioma". Additional GBM samples were analyzed from Ravi et al. (Cancer Cell 2022, DOI: 10.1016/j.ccell.2022.05.009 ). Sample names for these samples should be converted using " sampleID_conversion_GBM_Ravi22.csv " in order to run with our github code repo

主表 sampleID_conversion_GBM_Ravi22.csv 含 13 列、样本前 26 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 3.84 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.18380571。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/18380571

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-02-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.18380571

(注册/登录后按页面指引下载)

数据说明

该数据集是一个公开的空间转录组学数据集,专门针对胶质瘤研究。数据集包含了GBM(胶质母细胞瘤)和IDH突变胶质瘤样本的原始Visium空间转录组数据,这些数据来源于Hoefflin等人关于低级别和高级别IDH突变胶质瘤空间组织演化研究的论文。此外,还整合了Ravi等人(Cancer Cell 2022)研究中分析的额外GBM样本。数据以空间分辨的基因表达矩阵形式提供,包含细胞位置信息和基因表达谱。该数据集主要用于研究胶质瘤微环境的时空异质性、IDH突变状态对肿瘤空间组织的影响,以及肿瘤与免疫微环境的相互作用,为神经肿瘤学和空间生物学研究提供重要资源。

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