IDH野生型胶质母细胞瘤成像质谱流式数据集
该数据集包含8例IDH野生型胶质母细胞瘤和1例对照扁桃体的成像质谱流式数据，数据模态包括32位TIFF格式的多通道图像和单细胞表达表格，主要用于研究胶质母细胞瘤肿瘤微环境中髓系细胞的空间分布特征、细胞间相互作用及其与组织缺氧的关系，为肿瘤免疫微环境的空间生物学研究提供重要数据支持。
基本信息
资源简介
IDH野生型胶质母细胞瘤成像质谱流式数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Imaging mass cytometry data from IDH wildtype glioblastomas》。
【数据内容】
源站原始描述：Myeloid cells are highly prevalent in glioblastoma (GBM), existing in a spectrum of phenotypic and activation states. We now have limited knowledge of the tumor microenvironment (TME) determinants that influence the localization and the functions of the diverse myeloid cell populations in GBM. In this dataset, we have used imaging mass cytometry to identify and map the various myeloid populations in the human GBM tumor microenvironment (TME) using known markers for myeloid and neoplastic cells i…
【主题与分类】
主题标签：Multiplexing、Hyperion、imaging mass cytometry、Glioblastoma multiforme。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256:81b81c869ef5c1f88190ed8104d4296d656aa01039a32e1308ae202990c4606e
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是用于研究胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤微环境中髓系细胞分布与功能特征的成像质谱流式数据集。数据集包含8例原发性胶质母细胞瘤和1例扁桃体对照组织的成像数据，通过金属标记抗体染色和Hyperion系统成像获得。数据内容包括去噪后的32位TIFF格式图像文件（每个金属通道单独文件）、细胞表达表格（cell_table.csv）以及病例与感兴趣区域信息（Cases.xls）。该数据集通过单细胞水平的多重标记分析，揭示了不同髓系细胞群在肿瘤缺氧区域的特异性分布模式及同型/异型细胞相互作用，为研究胶质母细胞瘤免疫微环境的空间组织结构提供了重要资源。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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