硼替佐米与帕比司他联合处理LN229细胞的转录组分析

该数据集为GSE206984,来源于NCBI,主题为硼替佐米与帕比司他联合处理LN229细胞后的转录组分析,属于肿瘤/胶质母细胞瘤分类

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基因组分类GPL246769606
GSE206984: Transcriptomic analysis of LN229 cell treated by unit of bortezomib and panobinostat

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

硼替佐米与帕比司他联合处理LN229细胞的转录组分析

GSE206984 是一个聚焦于胶质母细胞瘤细胞转录组响应的公共数据集,来源于 NCBI,主题为硼替佐米(bortezomib)与帕比司他(panobinostat)联合处理 LN229 细胞后的转录组分析。该数据集属于肿瘤 / 胶质母细胞瘤分类,旨在通过高通量测序的表达谱分析,观察联合用药对 LN229 细胞基因表达的影响,并进一步探索药物作用于胶质母细胞瘤(GBM)细胞的机制。数据集由 Yuanyuan,Liu 提交,发布时间为 Jun 27 202,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE206984_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL24676 平台以及物种编号 9606。

【数据集背景】

胶质母细胞瘤是中枢神经系统常见的高侵袭性肿瘤,针对其开展药物干预后的转录组研究有助于理解药效与细胞反应。该数据集围绕 LN229 细胞系,采用硼替佐米与帕比司他联合处理,并通过表达谱分析观察处理后的转录组变化。源站描述指出,该研究应用这一联合用药方案处理 LN229 细胞,并进一步探索药物对 GBM 细胞的作用机制。数据集所属分类为肿瘤 / 胶质母细胞瘤,主题标签包含 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676 与 9606,表明其数据来自高通量测序表达谱分析,涉及人类样本,并关联特定测序平台。

【数据内容】

该数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE206984_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。文件内容对应 LN229 细胞在联合用药处理后的转录组表达谱数据。源站标题与描述均强调对 LN229 细胞进行硼替佐米与帕比司他联合处理后的转录组分析,因此数据内容的核心是表达谱层面的测量结果。关于样本数量、分组设计、具体基因数量或差异表达结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 公共数据资源。作者为 Yuanyuan,Liu,发布时间为 Jun 27 202。主题标签中的 GPL24676 指向所使用的测序平台,9606 指向人类物种。源站描述说明研究对 LN229 细胞应用硼替佐米与帕比司他联合处理,并进一步探索药物对 GBM 细胞的作用机制。除上述信息外,样本采集地点、细胞培养条件、测序试剂与仪器型号等实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于胶质母细胞瘤相关的基础研究场景,例如观察联合用药后 LN229 细胞的转录组表达变化、探索硼替佐米与帕比司他联合作用在 GBM 细胞中的潜在机制,以及作为高通量测序表达谱分析的参考数据。由于分类为肿瘤 / 胶质母细胞瘤,也可用于肿瘤药理学与转录组学交叉方向的数据比对或方法验证。具体适用性需结合源站描述与数据文件内容判断,源站未提供更细化的应用建议。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE206984_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于文件为 series matrix 形式,读取时需关注其表格结构与注释信息。关于具体分析步骤、标准化方法或推荐软件,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本组成信息有限。源站未提供样本数量、重复设置、测序深度、数据质控指标或差异表达分析结果等质量相关信息。使用时应注意数据仅涉及 LN229 细胞系与特定联合用药处理,结论外推到其他细胞系或药物方案需谨慎。发布时间为 Jun 27 202,年份信息不完整,源站未提供更精确的日期说明。

【引用与许可】

作者为 Yuanyuan,Liu,数据来源于 NCBI。源站未提供具体的引用格式、期刊信息或许可条款。使用或再分发该数据集时,应遵循 NCBI 的相关使用政策,并建议引用源站标题与作者信息。关于许可类型与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206984

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们报告了硼替佐米和帕比司他联合应用于LN229细胞的研究,并进一步探讨了这些药物对胶质母细胞瘤(GBM)细胞的作用机制。

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