原发与复发胶质母细胞瘤单核RNA测序数据集
包含80例IDH野生型GBM样本的单核RNA测序数据，覆盖40例原发与40例配对复发肿瘤。由National Center for Biotechnology Information提供，来自GEO，数据格式为表格，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的胶质母细胞瘤研究。
基本信息
资源简介
原发与复发胶质母细胞瘤单核RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《A single cell atlas of human glioma under therapy》。源站首次发布：May 17 202。
【数据内容】
源站原始描述：Most clinical trials for glioblastoma (GBM) enroll patients at recurrence. However, most pre-clinical animal models are of primary disease. Most studies have used tissues from primary tumors. Knowledge of GBM cellular composition at recurrence is limited. We profiled 80 human IDH-wild-type GBM specimens via single-nucleus RNA sequencing, 40 primary tumors and 40 patient-matched recurrent tumors. Select cohorts were also profiled via single-cell assay for transposase-accessible chromatin, single-…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21697、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE174554
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 02 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE174554
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含80例IDH野生型GBM样本的单核RNA测序数据，覆盖40例原发与40例配对复发肿瘤。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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