SOX2与SOX17在调控生殖细胞肿瘤命运中的独特与冗余作用
该数据集包含通过染色质免疫沉淀测序获得的SOX17在精原细胞瘤样细胞、体细胞以及SOX2在胚胎性癌样细胞中的基因结合位点信息，属于分子生物学与基因组学数据模态，主要用于研究睾丸生殖细胞肿瘤（如胚胎性癌和精原细胞瘤）中转录因子SOX2和SOX17在调控细胞多能性、分化抑制及肿瘤命运中的独特与冗余作用，为揭示生殖细胞肿瘤的分子机制和潜在治疗策略提供关键数据支持。
基本信息
资源简介
SOX2与SOX17在调控生殖细胞肿瘤命运中的独特与冗余作用
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Unique and redundant roles of SOX2 and SOX17 in regulating the germ cell tumor fate》。项目资助方：Wilhelm-Sander-Stiftung (2016.088.1 to HS, DN)。源站首次发布：2019-11-05。
【数据内容】
源站原始描述：Embryonal carcinomas (ECs) and seminomas are testicular germ cell tumors. ECs display expression of SOX2, while seminomas display expression of SOX17. In somatic differentiation, SOX17 drives endodermal cell fate. However, seminomas lack expression of endoderm markers, but show features of pluripotency. Here, we use chromatin immunoprecipitation sequencing to report and compare the binding pattern of SOX17 in seminoma-like TCam-2 cells to SOX17 in somatic cells and SOX2 in EC-like 2102EP cells.…
【数据结构与技术规格】
文件数 15 个，合计 420.83 MB。Unique and redundant roles of SOX2 and SOX17 in regulating the germ cell tumor fate.pdf：application/pdf，2.90 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.10252715.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified、Cancer cell biology、Cancer genetics、Cancer therapy (excl. chemotherapy and radiation therapy)、Cancer diagnosis、Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。主题标签：SOX2、SOX17、germ cell tumor、pluripotency、transcription factor、seminoma、embryonal carcinoma、urology、cancer、testis cancer。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified、Cancer cell biology、Cancer genetics、Cancer therapy (excl. chemotherapy and radiation therapy)、Cancer diagnosis、Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Unique_and_redundant_roles_of_SOX2_and_SOX17_in_regulating_the_germ_cell_tumor_fate/10252715
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Jostes, Sina; Fellermeyer, Martin; Arevalo, Lena; Merges, Gina E.; Kristiansen, Glen; Nettersheim, Daniel; et al. (2019). Unique and redundant roles of SOX2 and SOX17 in regulating the germ cell tumor fate. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集聚焦于睾丸生殖细胞肿瘤（包括胚胎性癌和精原细胞瘤），通过染色质免疫沉淀测序技术，比较了SOX17在精原细胞瘤样TCam-2细胞与SOX17在体细胞以及SOX2在胚胎性癌样2102EP细胞中的结合模式。数据集揭示了SOX17在精原细胞瘤中通过调控PRDM14、TFAP2C等基因维持潜在多能性并抑制体细胞分化的机制，同时发现SOX17在精原细胞瘤与体细胞中的结合位点仅12%重叠，表明其结合具有高度细胞类型特异性。此外，研究还表明SOX2在胚胎性癌中通过与OCT4协作调控多能性相关基因。该数据集为理解生殖细胞肿瘤的分子机制、细胞命运调控及潜在治疗靶点提供了关键实验证据。
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