半胱氨酸双加氧酶1(CDO1)基因启动子DNA高甲基化在原发性胆囊癌和胆囊疾病中的预后意义
该数据集包含胆囊癌患者及良性胆囊疾病患者的临床样本,通过定量PCR方法测量CDO1基因启动子DNA甲基化水平,并关联临床预后信息,数据模态包括基因甲基化数据和临床表格,主要用于研究胆囊癌的表观遗传生物标志物、评估CDO1高甲基化在预后预测中的作用,以及探索其在II期胆囊癌辅助治疗中的潜在应用价值。

基本信息
资源简介
半胱氨酸双加氧酶1(CDO1)基因启动子DNA高甲基化在原发性胆囊癌和胆囊疾病中的预后意义
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Prognostic significance of promoter DNA hypermethylation of the cysteine dioxygenase 1 (CDO1) gene in primary gallbladder cancer and gallbladder disease》。配套论文《Prognostic significance of promoter DNA hypermethylation of the cysteine dioxygenase 1 (CDO1) gene in primary gallbladder cancer and gallbladder disease》发表于 PLOS ONE(2017),DOI:10.1371/journal.pone.0188178。源站首次发布:2017-11-21。
【数据内容】
源站原始描述:Background Aberrant promoter DNA methylation of the cysteine dioxygenase 1 (CDO1) gene is found in various human cancers and is associated with clinical outcome. In this study, we assessed for the first time the clinicopathological significance of CDO1 methylation in primary gallbladder cancer (GBC) in comparison with non-malignant gallbladder disease. Methods CDO1 DNA methylation was quantified using quantitative TaqMan methylation specific PCR (Q-MSP) in 99 primary GBC patients together with t…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个,合计 273.16 KB。S1 Fig.tif:image/tiff,141.21 KB。S2 Fig.tif:image/tiff,100.83 KB。S1 Table.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,31.12 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0188178。
【主题与分类】
源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Physical Sciences not elsewhere classified、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签:PCR、stage II GBC、gallbladder cancer、CDO 1 hypomethylation、Q-MSP、CDO 1 TaqMeth value、Methods CDO 1 DNA methylation、xanthogranulomatous cholecystitis、non-malignant gallbladder disease、promoter DNA hypermethylation。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Physical Sciences not elsewhere classified、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Prognostic_significance_of_promoter_DNA_hypermethylation_of_the_cysteine_dioxygenase_1_CDO1_gene_in_primary_gallbladder_cancer_and_gallbladder_disease/5622136
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Igarashi, Kazuharu; Yamashita, Keishi; Katoh, Hiroshi; Kojima, Keita; Ooizumi, Yosuke; Nishizawa, Nobuyuki; et al. (2017). Prognostic significance of promoter DNA hypermethylation of the cysteine dioxygenase 1 (CDO1) gene in primary gallbladder cancer and gallbladder disease. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。
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数据说明
该数据集来自一项针对胆囊癌(GBC)和胆囊疾病的研究,旨在评估CDO1基因启动子DNA甲基化作为预后生物标志物的临床意义。数据集包含99例原发性胆囊癌患者、78例癌旁非肿瘤组织以及26例良性胆囊疾病(包括7例黄色肉芽肿性胆囊炎)的样本,样本采集时间为1986年至2014年。数据通过定量TaqMan甲基化特异性PCR(Q-MSP)方法测量CDO1甲基化水平,并关联临床病理特征和患者生存预后。研究发现CDO1高甲基化与胆囊癌患者不良预后显著相关,尤其在II期胆囊癌中可作为辅助治疗候选者的预测标志物。该数据集适用于胆囊癌的分子分型、表观遗传生物标志物开发及预后评估研究。
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