智利人祖先混合

整体而言,该数据集的名称、分类和病例-对照属性较为明确,但关于样本、变量、采集流程、使用方式、质量控制和许可等信息,源站未提供

dbgap
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基因组分类Case-Control
phs001385: Ancestry Admixture among Chileans

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

智利人祖先混合

该数据集英文名称为 phs001385: Ancestry Admixture among Chileans,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,被归入肿瘤/胆囊癌类别,主题涵盖病例-对照(Case-Control)研究。来源站描述其为 dbGaP study (Case-Control),属于公开数据集。整体而言,该数据集的名称、分类和病例-对照属性较为明确,但关于样本、变量、采集流程、使用方式、质量控制和许可等信息,源站未提供。

【数据集背景】

该数据集以 phs001385: Ancestry Admixture among Chileans 为英文名称,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。来源站将其描述为 dbGaP study (Case-Control),表明其与 dbGaP 研究相关,并采用病例-对照设计。其被归入肿瘤/胆囊癌类别,主题涵盖病例-对照(Case-Control)。除上述信息外,关于该数据集的研究背景、立项原因、研究机构、资助来源、研究目标、疾病选择依据、人群选择背景等,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的英文名称明确指向 Ancestry Admixture among Chileans,主题涵盖病例-对照(Case-Control),并被归入肿瘤/胆囊癌类别。就数据内容而言,目前可知其属于病例-对照研究,但具体包含哪些数据表、变量、样本数量、分组数量、基因型数据、祖源混合相关指标、临床信息、随访信息、人口学信息或胆囊癌相关表型,源站未提供。数据集是否包含原始测序数据、芯片数据、汇总统计结果或衍生变量,源站未提供。数据集的文件格式、数据字典、版本信息与更新记录,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。来源站描述为 dbGaP study (Case-Control)。除来源站点与 dbGaP 研究、病例-对照设计这一描述外,关于样本采集地点、采集时间、采集机构、研究对象来源、纳入与排除标准、伦理审查与知情同意方式、样本处理与实验方法、数据生成平台等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集被归入肿瘤/胆囊癌类别,主题涵盖病例-对照(Case-Control),来源站描述为 dbGaP study (Case-Control)。因此,在公开信息层面,它可作为与病例-对照设计相关的肿瘤/胆囊癌数据资源进行检索和了解。至于是否适合开展祖源混合分析、胆囊癌易感性分析、人群遗传结构分析、生物标志物发现、重分析或验证研究,以及是否适合特定统计模型或特定人群,源站未提供,需结合源站说明进一步确认。

【使用方法】

关于该数据集的下载地址、访问权限、申请流程、数据格式、读取工具、分析流程、质量控制步骤、参考基因组版本、软件参数和结果复现方式,源站未提供。使用者若需使用,应以 ncbi.nlm.nih.gov 及 dbGaP 相关页面的最新说明为准,并自行确认病例-对照设计下的分组定义、变量含义和许可条件。除这些原则性提示外,具体使用方法源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的质量信息,包括样本量、缺失率、批次效应、基因分型质控、祖源推断质控、病例与对照匹配情况、混杂控制、统计功效、偏倚来源和外部验证情况,源站未提供。由于公开描述仅涉及名称、来源、分类和病例-对照主题,无法据此判断其数据完整性、准确性、代表性或可重复性。数据可能存在的使用限制、伦理限制、隐私保护要求和访问层级,源站未提供。使用者应在获取数据时核对源站的最新说明。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、推荐引用文献、贡献者名单、DOI、PMID、数据库版本号、许可协议、使用条款、再分发规定和商业使用限制,源站未提供。若需引用或使用,应前往 ncbi.nlm.nih.gov 及其 dbGaP 相关页面查询正式引用与许可信息,并以源站发布内容为准。除此之外,关于该数据集在论文、报告或二次分析中的署名要求和致谢要求,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001385

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control).

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