滤泡性淋巴瘤肿瘤浸润淋巴细胞数据集 - 补充数据

该数据集包含130例滤泡性淋巴瘤患者的349个组织微阵列核心的多重免疫荧光图像数据,涵盖CD4、CD8、FOXP3、CD68、PD1、CD21等多种免疫细胞标记物及DAPI核染色的多光谱影像模态,并提供了近7万个细胞核的手动分割标注,主要用于肿瘤免疫微环境的定量分析、计算病理学模型开发以及研究免疫细胞浸润与滤泡性淋巴瘤疾病进展和治疗反应之间的关联。

Mendeley Data
2021-01-04 更新
浏览 16
肿瘤免疫微环境分析滤泡性淋巴瘤病理成像
Tumour Infiltrating Lymphocytes in Follicular Lymphoma - additional data

基本信息

大小
70.72 GB
创建/更新时间
2021-01-04
版本
v3

资源简介

滤泡性淋巴瘤肿瘤浸润淋巴细胞数据集 - 补充数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Tumour Infiltrating Lymphocytes in Follicular Lymphoma - additional data》。源站首次发布:2021-01-04。

【数据内容】

源站原始描述:The composition of the tumour microenvironment in follicular lymphoma (FL) is a relevant factor in determining disease progression and treatment response. This dataset is a collection of 349 FL diagnostic tissue micro-array (TMA) cores from 130 patients, stained using multi-plex immunofluorescence for: • CD4+ cells • Cytotoxic T cells (CD8+) • T regulatory cells (Tregs [CD4+FOXP3+]) • Macrophages (CD68+) • PD1+ lymphocytes • B cells/follicular dendritic cells (CD21+) • DAPI (4′,6-diamidino-2-phe…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 19.18 KB。数据集 DOI:10.17632/274xbhc5rx.3。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/274xbhc5rx

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源站:https://data.mendeley.com/datasets/274xbhc5rx

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个针对滤泡性淋巴瘤(FL)肿瘤微环境研究的医学影像数据集。它收集了来自130名患者的349个诊断性组织微阵列(TMA)核心样本,通过多重免疫荧光染色技术标记了CD4+细胞、细胞毒性T细胞(CD8+)、调节性T细胞(Tregs)、巨噬细胞(CD68+)、PD1+淋巴细胞、B细胞/滤泡树突状细胞(CD21+)以及DAPI核染色。数据包括原始.im3格式的多光谱图像、用于光谱分离的库图像以及69780个细胞核的手动分割标注。该数据集来源于英国曼彻斯特克里斯蒂NHS基金会信托的档案,旨在研究肿瘤免疫微环境组成与疾病进展、治疗反应之间的关系,适用于计算病理学、数字病理分析和肿瘤免疫学研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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