滤泡性淋巴瘤肿瘤浸润淋巴细胞核注释数据集

该数据集是一个针对滤泡性淋巴瘤病理图像中肿瘤浸润淋巴细胞的细胞核分割注释数据集,包含41个DAPI通道图像块及其对应的手动标注的细胞核掩码标签,共计69,780个细胞核轮廓,主要用于病理图像分析领域的细胞核自动分割算法开发与验证,以及淋巴瘤组织微环境的定量研究。

Mendeley Data
浏览 12
病理图像细胞核分割淋巴瘤组织学分析
Tumor Infiltrating Lymphocytes in Follicular Lymphoma - Nuclear Annotations

基本信息

大小
0.006273224 GB
创建/更新时间
2026-09-20
版本
v1

资源简介

滤泡性淋巴瘤肿瘤浸润淋巴细胞核注释数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Tumour Infiltrating Lymphocytes in Follicular Lymphoma -Nuclear annotations》。源站首次发布:2021-01-04。

【数据内容】

源站原始描述:Annotations - In a follicular lymphoma dataset, annotations are provided for nuclear segmentation. In a set of 41 small patches the outlines have been drawn manually for 69780 nuclei. A patch from the DAPI channel and corresponding label are given as .tif images. Labels are 16-bit integer mask arrays where all pixels belonging to each nucleus are randomly assigned an integer number. Some patches contain no stained nuclei, as negative controls. Additional information on preparation of…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 6.27 MB。数据集 DOI:10.17632/nb46s9trx3.1。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/nb46s9trx3

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使用方式

数据集获取

源站:https://data.mendeley.com/datasets/nb46s9trx3

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了滤泡性淋巴瘤病理图像中细胞核的详细注释信息,包含41个小图像块中69,780个细胞核的手动轮廓标注。数据以DAPI通道图像和对应的标签图像形式提供,标签为16位整数掩码数组,每个细胞核的像素被随机分配一个整数值作为标识。部分图像块作为阴性对照不包含染色细胞核。该数据集适用于病理图像细胞核分割和淋巴瘤组织学分析研究,可用于开发或评估细胞核自动分割算法,支持肿瘤微环境及淋巴细胞浸润的定量分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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