滤泡性淋巴瘤单细胞RNA测序数据集
包含滤泡性淋巴瘤活检样本的单细胞RNA测序数据,可用于肿瘤细胞和免疫微环境分析。由Chan Zuckerberg CELLxGENE提供,来自CELLxGENE Discover,数据格式为表格,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
滤泡性淋巴瘤单细胞RNA测序数据集
【一句话概览】
对滤泡性淋巴瘤患者进行核心针活检,通过物理解离经滤网分散组织,并加载至10X Chromium平台,采用5''化学法进行单细胞RNA测序。样本涉及滤泡性淋巴瘤、淋巴结及正常组织,物种为人,测序平台为10x 5'' v1(来源 cellxgene.cziscience.com)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single cell RNA sequencing of follicular lymphoma》。
【数据内容】
源站原始描述:Core needle biopsies were obtained from patients with follicular lymphoma, disaggregated by physical dissociation through mess, and loaded onto a 10X Chromium for single cell RNA-sequencing using 5’ chemistry
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):从滤泡性淋巴瘤患者获取粗针穿刺活检样本,通过物理解离方法(使用网筛)将其分散,并加载到10X Chromium平台上,采用5''化学法进行单细胞RNA测序。
【主题与分类】
主题标签:follicular lymphoma、lymph node、normal、10x 5'' v1、Homo sapiens、single cell RNA sequencing。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/968834a0-1895-40df-8720-666029b3bbac
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://cellxgene.cziscience.com/collections/968834a0-1895-40df-8720-666029b3bbac
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含滤泡性淋巴瘤活检样本的单细胞RNA测序数据,可用于肿瘤细胞和免疫微环境分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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