38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数
该数据集包含38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数，数据模态为RNA测序转录组数据，通过常规bulk RNA-seq技术生成，经过标准化处理，主要用于研究滤泡性淋巴瘤的基因表达特征、差异基因表达分析以及生物标志物发现等转录组研究方向。
基本信息
资源简介
38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene-level read counts from bulk RNA-seq data for 38 follicular lymphoma diagnostic biopsies》。源站首次发布：2022-08-21。
【数据内容】
源站原始描述：Conventional (bulk) RNA-sequencing was performed on unfractionated cell suspension or snap frozen whole tissue material. Total RNA was isolated with TRIzol reagent followed by purification over PureLink RNA Mini Kit columns (Invitrogen). RNA-seq was performed using a polyA-enriched strand-specific library construction protocol (doi: 10.1016/j.ccell.2016.02.009) and paired-end 75bp sequencing on an Illumina HiSeq 2500 instrument. Raw reads were aligned to the reference human genome assembly GRCh3…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 9.95 MB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.7013885。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/7013885
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2022-08-22，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/record/7013885
（注册/登录后按页面指引下载）
数据说明
该数据集包含38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数，来源于常规（bulk）RNA测序数据。数据通过TRIzol试剂提取总RNA，使用polyA富集的链特异性文库构建协议，在Illumina HiSeq 2500仪器上进行双端75bp测序。原始读数通过STAR比对到人类参考基因组GRCh37，并使用HTSEQ-count进行基因水平读数量化。经过低表达基因过滤后，数据通过edgeR包进行TMM标准化和CPM缩放。该数据集主要用于研究滤泡性淋巴瘤的基因表达特征，支持转录组分析、差异基因表达检测和生物标志物发现等研究方向。
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