38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数
该数据集包含38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数,数据模态为RNA测序转录组数据,通过常规bulk RNA-seq技术生成,经过标准化处理,主要用于研究滤泡性淋巴瘤的基因表达特征、差异基因表达分析以及生物标志物发现等转录组研究方向。
创建时间2022-08-21
更新时间2022-08-21
资源简介
该数据集包含38例滤泡性淋巴瘤诊断活检样本的基因水平读数,来源于常规(bulk)RNA测序数据。数据通过TRIzol试剂提取总RNA,使用polyA富集的链特异性文库构建协议,在Illumina HiSeq 2500仪器上进行双端75bp测序。原始读数通过STAR比对到人类参考基因组GRCh37,并使用HTSEQ-count进行基因水平读数量化。经过低表达基因过滤后,数据通过edgeR包进行TMM标准化和CPM缩放。该数据集主要用于研究滤泡性淋巴瘤的基因表达特征,支持转录组分析、差异基因表达检测和生物标志物发现等研究方向。
提供机构:Zenodo
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