GSE84976炎症表型葡萄膜黑色素瘤数据集

GSE84976聚焦具有炎症表型的葡萄膜黑色素瘤,包含与白细胞浸润、HLA表达和转移风险相关的表达数据。由NCBI提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的眼黑色素瘤研究。

NCBINCBI
Gene Expression Omnibus
2018-08-13 更新
浏览 16
表格分类Expression profiling by arrayGPL105589606
GSE84976

基本信息

模态
表格
大小
0.042991876 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-08-13

资源简介

GSE84976炎症表型葡萄膜黑色素瘤数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Upregulation of HLA expression in primary Uveal Melanoma by infiltrating leukocytes》。源站首次发布:Jul 29 201。

【数据内容】

源站原始描述:Uveal melanoma (UM) with an inflammatory phenotype, characterized by infiltrating leukocytes and increased human leukocyte antigen (HLA) expression, carry an increased risk of death due to metastases. These tumors shoud be ideal for T-cell based therapies, yet it is not clear why prognostically-infaust tumors have a high HLA expression. We set out to determine whether the level of HLA molecules in UM is associated with other genetic factors, HLA transcriptional regulators, or microenvironmental…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE84976

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE84976

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

GSE84976聚焦具有炎症表型的葡萄膜黑色素瘤,包含与白细胞浸润、HLA表达和转移风险相关的表达数据。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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