GSE139829葡萄膜黑色素瘤单细胞数据集
GSE139829包含原发和转移性葡萄膜黑色素瘤的单细胞RNA测序数据，用于肿瘤微环境和细胞异质性研究。由NCBI提供，来自Gene Expression Omnibus，数据格式为表格，包含59915条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的眼黑色素瘤研究。
基本信息
资源简介
GSE139829葡萄膜黑色素瘤单细胞数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single-cell analysis reveals new evolutionary complexity in uveal melanoma》。源站首次发布：Nov 01 201。
【数据内容】
源站原始描述：Uveal melanoma (UM) is a highly metastatic cancer that, in contrast to cutaneous melanoma, is largely unresponsive to checkpoint immunotherapy. In this study we interrogate the tumour microenvironment at single-cell resolution using scRNA-seq of 59,915 tumour and non-neoplastic cells from 8 primary and 3 metastatic samples. A subset analysis of tumour cells confirms the global genomic landscape established from bulk analysis and reveals newly described subclonal genomic complexity and transcript…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24268、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139829
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 27 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139829
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE139829包含原发和转移性葡萄膜黑色素瘤的单细胞RNA测序数据，用于肿瘤微环境和细胞异质性研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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