EWS-FLI1调控元件数据集
GSE61944记录EWS-FLI1在尤文肉瘤中重编程增强子和染色质调控网络的数据，适合调控机制研究。由National Center for Biotechnology Information提供，来自GEO，数据格式为表格，适用于分类任务。
基本信息
资源简介
EWS-FLI1调控元件数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-wide chromatin analysis of Ewing sarcoma (ChIP-seq)》。源站首次发布：Oct 01 201。
【数据内容】
源站原始描述：We show that EWS-FLI1, an aberrant transcription factor responsible for the pathogenesis of Ewing sarcoma, reprograms gene regulatory circuits by directly inducing or directly repressing enhancers. At GGAA repeats, which lack regulatory potential in other cell types and are not evolutionarily conserved, EWS- FLI1 multimers potently induce chromatin opening, recruit p300 and WDR5, and create de novo enhancers. GGAA repeat enhancers can loop to physically interact with target promoters, as demonst…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing、GPL11154、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE61944
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE61944
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE61944记录EWS-FLI1在尤文肉瘤中重编程增强子和染色质调控网络的数据，适合调控机制研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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