人类嗅神经母细胞瘤单核RNA测序数据
包含1例人类嗅神经母细胞瘤肿瘤样本的10x Genomics单核RNA-seq数据,可用于细胞状态和肿瘤异质性分析。由Duke University提供,来自NCBI GEO,数据格式为表格,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
人类嗅神经母细胞瘤单核RNA测序数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Olfactory neuroblastoma mimics molecular subtypes and lineage trajectories of small cell lung cancer [Single nucleus RNA-seq on human ONB tumor]》。源站首次发布:Nov 27 202。
【数据内容】
源站原始描述:The olfactory epithelium relies on active neuron regeneration from basal stem cells and is susceptible to olfactory neuroblastoma (ONB), a rare, aggressive tumor of unclear origins. Here, we establish a new, highly-penetrant, genetically-engineered mouse model of ONB with alterations in Rb1/Trp53/Myc that exhibit a NEUROD1+ immature neuronal state. ASCL1 loss leads to emergence of non-neuronal histopathologies, including a POU2F3+ microvillar-like state. We find ONB tumor heterogeneity to recapi…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248746
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 28 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248746
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含1例人类嗅神经母细胞瘤肿瘤样本的10x Genomics单核RNA-seq数据,可用于细胞状态和肿瘤异质性分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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