嗅神经母细胞瘤患者肿瘤转录组分析

包含4例嗅神经母细胞瘤患者肿瘤FFPE样本与健康对照RNA表达芯片数据,可用于差异表达和分子通路分析。由UCLA提供,来自NCBI GEO,数据格式为表格,包含5条数据记录,适用于分类任务。

UCLAUCLA
NCBI GEO
2018-01-24 更新
浏览 19
表格分类Expression profiling by arrayGPL149519606
GSE102285

基本信息

模态
表格
大小
0.000980992 GB
数据量
5
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-01-24

资源简介

嗅神经母细胞瘤患者肿瘤转录组分析

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Transcriptome analysis of tumors from Olfactory neuroblastoma patients》。源站首次发布:Aug 04 201。

【数据内容】

源站原始描述:The RNA from tumors of four olfactory neuroblastoma patients were studied to understand the molecular pathways perturbed in such tumors. The resulting up and down regulated genes were used to look for novel cellular pathways that are commonly perturbed in plfactory neuroblastoma

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL14951、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE102285

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 24 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含4例嗅神经母细胞瘤患者肿瘤FFPE样本与健康对照RNA表达芯片数据,可用于差异表达和分子通路分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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