食管癌研究的肠道过滤器数据集
ArrayExpress来源的食管癌基因表达数据集，用于肠道相关过滤器研究。
基本信息
资源简介
食管癌研究的肠道过滤器数据集
【一句话概览】
本研究利用正常胃肠道组织的检查，确定组织特异性信号，用于推导食管肠化生的肠道特征。在知情同意后，获取正常食管、结肠和十二指肠组织活检，并在相邻组织经组织学检查为正常外观黏膜后提取RNA，每种组织类型各三例。标签为转录组芯片分析和人类（来源 BioStudies）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《INTESTINAL FILTER FOR USE IN OESOPHAGEAL CANCER RESEARCH》。
【数据内容】
源站原始描述：This study utilise the examination of normal gastro-intestinal tissues to determine a tissue specific signal for use in deriving the intestinal signature of intestinal metaplasias of the oesophagus. Normal oesophageal, colonic and duodenal tissue biopsies were taken after informed consent and RNA was extracted following histological examination of adjacent tissues for normal aperaing mucosa. Three of each tissue type
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-40220
下载信息
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使用方式
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源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-40220
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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